الاختلاف الرئيسي بين تسلسل الجينوم الكامل وتسلسل الإكسوم هو أن تسلسل الجينوم بأكمله يسلسل الجينوم الكامل للكائن الحي بينما تسلسل تسلسل الإكسوم يتسلسل فقط الإكسوم أو جينات ترميز البروتين للكائن الحي.
التسلسل هي تقنية تحدد الترتيب الدقيق للنيوكليوتيدات في جزيء DNA معين. إنه يعكس فقط الترتيب الصحيح للقواعد الأربع ؛ الأدينين (A) والجوانين (G) والسيتوزين (C) والثايمين (T) في جزء من الحمض النووي. هناك العديد من طرق التسلسل مثل تسلسل Sanger وتسلسل الجيل التالي وما إلى ذلك. علاوة على ذلك ، يمكن أن يخضع تسلسل الجينوم الكامل للكائن الحي (تسلسل الجينوم الكامل) أو جينات ترميز البروتين فقط في الجينوم (تسلسل الإكسوم).
ما هو تسلسل الجينوم الكامل؟
يحتوي الجينوم البشري على ما يقرب من ثلاثة مليارات زوج أساسي من الحمض النووي. تسلسل الجينوم الكامل هو طريقة ترتب الجينوم الكامل للكائن الحي. لذلك ، في تسلسل الجينوم الكامل ، يكون الاعتبار على المجموعة الكاملة لجزيئات الحمض النووي بما في ذلك الإكسومات ، والإنترونات ، والمسافات بين الجينات ، وما إلى ذلك ، علاوة على ذلك ، فإن تسلسل الجينوم الكامل ليس فقط الجينوم الموجود داخل النواة ولكن أيضًا الحمض النووي للميتوكوندريا أيضًا
الشكل 01: تسلسل الجينوم الكامل
في التحضير لهذا التسلسل ، فإن الخطوة الأولى هي استخراج الحمض النووي بالكامل. بعد ذلك ، يخضع الحمض النووي المستخرج لإجراء التسلسل باستخدام طريقة التسلسل المناسبة.من خلال تحليل التسلسلات الناتجة ، باستخدام أداة المعلوماتية الحيوية ، يمكننا معرفة الأمراض النادرة ، والسرطان ، والأمراض المعدية ، وما إلى ذلك.
ما هو تسلسل إكسوم؟
Exome هو جزء من الجينوم يحتوي على حوالي 1.5٪ من الجينوم ، وهو عبارة عن مجموعة من exons. الإكسونات هي التسلسلات التي يتم نسخها إلى mRNA ثم إلى منتج البروتين النهائي. ومن ثم ، فإن تسلسل الإكسوم يسلسل تسلسل ترميز البروتين بأكمله في الجينوم. يكشف تسلسل إكسوم عن الاضطرابات الوراثية لأن معظم الاضطرابات الجينية تنشأ بسبب طفرات جينات ترميز البروتين. ومن ثم ، فإن عمليات تشخيص الاضطرابات الوراثية كثيرًا ما تستخدم تسلسل الإكسوم كوسيلة لتشخيص المرض. أيضًا ، عند المقارنة مع تطبيق تسلسل الجينوم بأكمله للاختبار الجيني ، فإن تسلسل الإكسوم يستغرق وقتًا أقل في الاستخدام وأقل تكلفة.
الشكل 02: تسلسل إكسوم
في تسلسل الإكسوم ، أولاً ، من الضروري تحديد تسلسل ترميز البروتين فقط من إجمالي الحمض النووي. لاحظ أن البشر لديهم حوالي 180000 تسلسل لترميز البروتين. بعد ذلك ، يتم تسلسل الإكسوم باستخدام طريقة تسلسل عالية الإنتاجية.
ما هي أوجه التشابه بين تسلسل الجينوم الكامل وتسلسل إكسوم؟
- تسلسل الجينوم الكامل وتسلسل إكسوم هما تطبيقان للتسلسل.
- كلا الطريقتين مفيدتان في تحديد الترتيب الصحيح لتسلسل النيوكليوتيدات في كلتا الطريقتين.
- أيضًا ، تساعد المعلوماتية الحيوية في كلا التقنيتين لتحليل البيانات.
ما هو الفرق بين تسلسل الجينوم الكامل وتسلسل إكسوم؟
تسلسل الجينوم الكامل يسلسل الحمض النووي الكامل لجينوم الكائن الحي ، بينما تسلسل الإكسوم فقط تسلسل ترميز البروتين من الجينوم.لذلك ، هذا هو الفرق الأساسي بين تسلسل الجينوم الكامل وتسلسل الإكسوم. أيضًا ، على الرغم من استخدام كلتا الطريقتين على نطاق واسع لتحديد الترتيب الصحيح لتسلسل النيوكليوتيدات ، فإن تسلسل الجينوم بأكمله مكلف ويستغرق وقتًا طويلاً من تسلسل الإكسوم.
جدول المعلومات أدناه هو الفرق بين تسلسل الجينوم الكامل وتسلسل إكسوم.
ملخص - تسلسل الجينوم الكامل مقابل تسلسل إكسوم
التسلسل يكشف الترتيب الدقيق للقواعد في جزء DNA ويمكن أن يكون إما تسلسل جينوم كامل أو تسلسل exome. هنا ، تسلسل الجينوم بأكمله يسلسل الجينوم الكامل للكائن الحي بينما تسلسل الإكسوم يسلسل فقط تسلسل ترميز البروتين في الجينوم.بالنظر إلى تطبيقاتهم ، فإن تسلسل الجينوم بأكمله مفيد في تحليل الانحرافات الجينية مثل الاختلافات النوكليوتيدية المفردة ، والحذف ، والإدخال ، وما إلى ذلك في الجينوم الكامل بينما تسلسل الإكسوم مفيد في اكتشاف الأمراض الوراثية. لذلك ، هذا هو الفرق بين تسلسل الجينوم الكامل وتسلسل الإكسوم.
