الاختلاف الرئيسي بين التسلسل الهرمي وتسلسل الجينوم الكامل هو أنه في التسلسل الهرمي للبندقية ، يتم تقسيم الجينوم إلى أجزاء أكبر قبل التسلسل ، بينما في تسلسل بندقية الجينوم الكامل ، يتم تقسيم الجينوم بأكمله إلى أجزاء صغيرة للتسلسل
التسلسل هو تقنية مهمة في العمليات الجزيئية ، لا سيما في التحديد الدقيق للأنواع. في الواقع ، إنها تقنية تحديد الترتيب الدقيق للنيوكليوتيدات في الجين أو الجينوم. هناك العديد من تقنيات التسلسل. بعض هذه الطرق تشمل Maxam Gilbert Method و Sanger Method وطريقة Sanger الآلية.
ما هو التسلسل الهرمي للبندقية؟
التسلسل الهرمي للبندقية هو إحدى طرق التسلسل. ويسمى أيضًا "التسلسل التنازلي". علاوة على ذلك ، تتكون هذه الطريقة من خطوتين: الخطوة الأولى هي تضخيم الجينوم ، والخطوة الثانية هي تجزئة الجينوم. في هذه الطريقة ، يتم تقطيع الجينوم إلى أجزاء كبيرة أولاً. يتبع ذلك استنساخ هذه الأجزاء الكبيرة في مضيفات مختلفة باستخدام نواقل أو كروموسومات اصطناعية. ثم يتم ترتيب هذه النواقل المؤتلفة في مكتبة. أثناء تسلسل البندقية ، تخضع استنساخ ناقلات المؤتلف للتسلسل بشكل فردي. تخضع الأجزاء الموجودة في الحيوانات المستنسخة لعملية الهضم التقييدية لتقليل حجم الجينوم بشكل أكبر ، وبالتالي تخضع للتسلسل.
الشكل 01: التسلسل الهرمي للبندقية
أثناء التسلسل الهرمي للبندقية ، يجب ترتيب القطع الكبيرة من الشظايا بالترتيب ، قبل تسلسل البندقية. يحدث بمساعدة الواسمات الجزيئية المدمجة أثناء عملية الاستنساخ.
التسلسل الهرمي للبندقية يخلق خريطة جينية منخفضة الدقة. لكنه ينشئ خريطة تسلسل مرتبة. وبالتالي ، يستغرق الأمر مدة أطول من التسلسل المباشر. تتأخر العملية برمتها بسبب إنشاء مكتبة ناقلات مؤتلف. هل هي أيضًا تقنية تتطلب عمالة مكثفة. ومع ذلك ، في الوقت الحاضر ، فإن التقنية مؤتمتة لتسهيل العمل.
ما هو تسلسل الجينوم الكامل للبندقية؟
تسلسل بندقية الجينوم الكامل هو عملية تسلسل بخطوة واحدة. في هذه العملية ، يتم قص الجينوم بالكامل أولاً. بعد ذلك ، يخضع كل جزء من هذه الأجزاء الصغيرة للتسلسل العشوائي. عند الانتهاء من التسلسل ، يتم تحليل التسلسل.أثناء تحليل التسلسل ، تتم إزالة التسلسلات المتداخلة ، ولا يكون التحليل عملية مرتبة. لذلك ، يعد تجميع التسلسلات عملية أقل كفاءة مقارنةً بتسلسل بندقية التسلسل الهرمي. ومع ذلك ، فإن عملية تسلسل الجينوم الكامل للبنادق تكون أسرع ، ويمكن أن يتم تحليل الجينوم بأكمله في حالة واحدة.
ما هي أوجه التشابه بين التسلسل الهرمي وتسلسل بندقية الجينوم الكامل؟
- التسلسل الهرمي و التسلسل الكامل لبندقية الجينوم هما طريقتان للتسلسل.
- كلاهما يخضع لتسلسل سانجر أو طرق تسلسل سانجر الآلية.
- يشاركون في تسلسل أجزاء DNA و RNA.
- علاوة على ذلك ، كلا الطريقتين مهمتان في التشخيص الجزيئي وأغراض البحث.
- في الوقت الحاضر ، كلتا الطريقتين مؤتمتة أو تعتمد على الكمبيوتر.
- كلا الأسلوبين يعتمدان على تجزئة الجينوم.
ما هو الفرق بين التسلسل الهرمي وتسلسل الجينوم الكامل للبندقية؟
التسلسل الهرمي للبندقية يولد شظايا أكبر حجمًا بالمقارنة مع تسلسل بندقية الجينوم الكامل ، والذي يعمل مع أجزاء صغيرة من التسلسلات. لذلك ، هذا هو الفرق الرئيسي بين التسلسل الهرمي وتسلسل الجينوم الكامل. إلى جانب ذلك ، يتكون التسلسل الهرمي للبندقية من خطوتين رئيسيتين ، بينما يعتمد تسلسل بندقية الجينوم الكامل على خطوة رئيسية واحدة.
علاوة على ذلك ، هناك اختلاف آخر بين التسلسل الهرمي وتسلسل بندقية الجينوم الكامل وهو أن الدقة أعلى في تسلسل بندقية الجينوم الكامل مقارنةً بالتسلسل الهرمي للبندقية.
الرسم البياني أدناه يلخص الفرق بين التسلسل الهرمي وتسلسل الجينوم الكامل.
ملخص - التسلسل الهرمي مقابل تسلسل بندقية الجينوم الكامل
التسلسل الهرمي وتسلسل الجينوم الكامل هما طريقتان لتسلسل الجينوم الكبير. التسلسل الهرمي للبندقية هو عملية من خطوتين للتسلسل حيث يتم تقسيم الجينوم إلى أجزاء أكبر. في المقابل ، فإن تسلسل بندقية الجينوم الكامل هو تسلسل من خطوة واحدة حيث يتم تقسيم الجينوم إلى أجزاء صغيرة ويتم تسلسلها مباشرة. وبالتالي ، هذا هو الفرق الرئيسي بين التسلسل الهرمي وتسلسل الجينوم الكامل. علاوة على ذلك ، قد تختلف الجوانب الفنية بين التقنيتين.
