الاختلاف الرئيسي بين crRNA tracrRNA و gRNA هو أن crRNA هو أحد نوعي RNA لـ CRISPR ، وهو مكمل لتسلسل الحمض النووي المستهدف ، بينما tracrRNA هو النوع الثاني من RNA لـ CRISPR ، والذي يعمل بمثابة سقالة ملزمة لـ Cas nuclease و gRNA هي أحد المكونين الرئيسيين لنظام CRISPR-Cas9 للبكتيريا والعتائق الذي يتعرف على الحمض النووي المستهدف ويوجه بروتينات Cas لعمل فواصل مزدوجة في الحمض النووي المستهدف.
CRISPR تعني التكرارات العنقودية المنتظمة القصيرة المتناوبة. إنه أحد أجهزة المناعة في البكتيريا والعتائق. تستخدم البكتيريا والعتائق هذا النظام لحماية نفسها من مسببات الأمراض الفيروسية.إنها واحدة من أكثر الآليات المدهشة التي تنطوي على تعديل وراثي ناجح. تُستخدم هذه الآلية (CRISPR-Cas9) كأداة جديدة لتحرير الجينات في مجال التكنولوجيا الحيوية. لقد أحدثت تطورات جديدة في التكنولوجيا الحيوية ، لا سيما في مجال الهندسة الوراثية.
هناك مكونان رئيسيان لنظام CRISPR-Cas9. هم الحمض النووي الريبي التوجيهي (جرنا) ونوكليازات (كاس) المرتبطة بكريسبر. توجيه RNA هو تسلسل RNA محدد يوجه بروتينات Cas لشق الحمض النووي المستهدف. يتكون دليل RNA من نوعين من RNA. هم كريسبر RNA (كرنا) و tracrRNA. إن نوكليازات (Cas) المرتبطة بـ CRISPR هي نوكليازات داخلية غير محددة تقوم بعمل فواصل مزدوجة في الحمض النووي المستهدف. من خلال إجراء فواصل مزدوجة في الحمض النووي المستهدف ، تقوم البكتيريا والعتائق بتوجيه آليات الإصلاح الذاتية الخاصة بهم لتعطيل الحمض النووي الفيروسي.
ما هو كرنا؟
crispr أو Crispr RNA هو أحد نوعي RNA الدليل. من الناحية الهيكلية ، هو عبارة عن تسلسل نيوكليوتيد 17-20. الميزة الأكثر قيمة لـ crRNA هي أنها مكملة للحمض النووي المستهدف.لذلك ، تتطابق crRNA مع تسلسل الحمض النووي الفيروسي. تعتمد خصوصية نظام CRISPR-Cas 9 على crRNA. في البكتيريا ، يوجد كرنا مدمجًا في تسلسل tracrRNA ، وهو النوع الثاني من CRISPR RNA. يتم تشغيل إنتاج كرنا عن طريق إعادة تعرض البكتيريا للفيروس. عند التعرض ، يتم نسخ الجين الذي يقوم بترميز crRNA. ثم تبدأ آلية الدفاع ضد الفيروس.
الشكل 01: نظام CRISPR-Cas9
ما هو tracrRNA؟
التنشيط عبر crRNA أو tracrRNA هو الجزء الثاني من guideRNA أو CRISPR RNA. يتم نطقه على أنه تتبع الحمض النووي الريبي (RNA). يعمل tracrRNA كسقالة ملزمة لبروتين نوكلياز كاس 9. بمعنى آخر ، يعمل tracrRNA كمقبض لتوجيه Cas9 نحو الحمض النووي المستهدف.من الناحية الهيكلية ، يحتوي tracrRNA على 42 نيوكليوتيد. كان موجودا مع كرنا.
ما هو جرنا؟
Guide RNA أو gRNA هو أحد المكونين الرئيسيين لجهاز المناعة CRISPR-Cas9. إنه تسلسل RNA محدد يتكون من عنصرين: crRNA و tracrRNA. تتعرف gRNA على الحمض النووي المستهدف وتوجه بروتينات Cas لعمل شقوق مزدوجة في الحمض النووي المستهدف. من أجل القيام بذلك ، يتكون crRNA من تسلسل مكمل للحمض النووي المستهدف بينما يوجه tracrRNA بروتينات Cas التي تعمل كمقبض.
الشكل 02: جرنا
تصميم جرنا الصحيح هو خطوة حاسمة في أداة تحرير الجينات CRISPR-Cas9. لذلك ، يعتمد نجاح وكفاءة التحرير لنظام CRISPR على التسلسل الصحيح لـ gRNA. يمكن التعبير عن جرنا في خلايا من بلازميد منقولة.عندما يتم إدخال البلازميدات المستنسخة في الخلايا ، تولد الخلايا المضيفة جرنا. يتكون جرنا الأكثر شيوعًا من 100 زوج أساسي.
ما هي أوجه التشابه بين crRNA tracrRNA و gRNA؟
- crRNA و tracrRNA و gRNA هي تسلسلات RNA موجودة في البكتيريا والعتائق.
- جميعهم ينتمون إلى نظام كريسبر
- جرنا مصنوع من كرنا و tracrRNA.
- يشاركون في التعرف على الحمض النووي للعاثيات وتوجيه نوكليازات داخلية نحو الحمض النووي المستهدف.
- ومن ثم ، تشارك جميع الأنواع الثلاثة من الحمض النووي الريبي في توجيه نوكلياز Cas9 لعمل فواصل مزدوجة في غزو المواد الوراثية الأجنبية.
- يعتمد نجاح تجربة كريسبر على جميع الأنواع الثلاثة من الحمض النووي الريبي.
ما هو الفرق بين crRNA tracrRNA و gRNA؟
crRNA هو جزء من جرنا من كريسبر مكمل للحمض النووي المستهدف ، في حين أن tracrRNA هو الجزء الثاني من جرنا ، والذي يعمل بمثابة سقالة ملزمة لنيوكلياز كاس.جرنا هو مزيج من crRNA و tracrRNA ، وهو أحد المكونين لنظام CRISPR-Cas9 ، الذي يتعرف على الحمض النووي المستهدف ويوجه النيوكليازات لعمل فواصل مزدوجة في الحمض النووي الهدف. إذن ، هذا هو الفرق الرئيسي بين crRNA tracrRNA و gRNA.
يلخص الجدول التالي الفرق بين crRNA tracrRNA و gRNA.
ملخص - crRNA vs tracrRNA vs gRNA
نظام CRISPR-Cas9 هو جهاز مناعي للبكتيريا والعتائق. يستخدم هذا النظام كأداة لتحرير الجينات في التكنولوجيا الحيوية. يتكون CRISPR من نوعين من الحمض النووي الريبي ، وهما CRISPR RNA (crRNA) ومعاملات CRISPR RNA (tracrRNA). تُعرف مجتمعة باسم guideRNA أو gRNA. يتعرف هذا الحمض النووي الريبي على التسلسلات المستهدفة لمسببات الأمراض الغازية ويوجه نوكليازات داخلية لعمل فواصل مزدوجة في الحمض النووي المستهدف. بمجرد إجراء فواصل مزدوجة الخيط في المادة الوراثية الأجنبية ، فإن آلية الإصلاح الداخلية (انضمام طرف غير متماثل ؛ NHEJ) تعمل على تعطيل الحمض النووي الغريب عن طريق إدخال الطفرات.وهكذا ، هذا يلخص الفرق بين crRNA tracrRNA و gRNA.
