الاختلاف الرئيسي بين التنميط متعدد العناصر وتنميط الريبوسوم هو أن التنميط متعدد السومات يحلل سلوك الريبوسوم باستخدام كل من الريبوسوم و mRNA (متعدد السوم) أثناء الترجمة ، بينما يحلل التنميط الريبوسوم سلوك الريبوسوم فقط باستخدام تسلسل الرنا المرسال أثناء الترجمة.
الترجمة هي المرحلة الثانية من تخليق البروتين التي تحول المعلومات الموجودة في mRNA إلى تسلسل الأحماض الأمينية. Translatomics هي دراسة لـ ORFs (إطارات القراءة المفتوحة) التي تُترجم بنشاط في خلية كائن حي. تعد تقنيات التنميط المتعدد والريبوسوم نوعين من التقنيات في مجال البيولوجيا الجزيئية لتقييم واستنتاج المعلمات المختلفة في سياق تحليل الترجمة.
ما هو التنميط Polysome؟
التنميط Polysome هي تقنية تستنتج حالة ترجمة mRNA معين من خلال تحليل سلوك كل من الريبوسوم و mRNA (polysome). بمعنى آخر ، توفر هذه التقنية بيانات واستنتاجات حول ارتباط الرنا المرسال مع الريبوسومات. يشير polysome إلى مجموعة الريبوسومات المرتبطة بـ mRNA الموجودة أثناء مرحلة الاستطالة في الترجمة.
الشكل 01: التنميط Polysome
يتطلب التنميط Polysome محللة الخلية ، والتي يتم بعد ذلك الطرد المركزي. ثم يتم فصل العينة التي تم طردها من المركز بناءً على كثافتها لتمييز الوحدات الفرعية الصغيرة والكبيرة من الريبوسومات و mRNA المقابل الذي يشارك في تكوين polysome.علاوة على ذلك ، تتضمن العملية أيضًا قياس الكثافة الضوئية. الخبراء مطلوبون لأداء التنميط المتعدد.
تعد تقنية التنميط Polysome أداة مهمة للعديد من التطبيقات. يستخدم العلماء هذه التقنية لدراسة درجة الترجمة في الخلايا. بشكل أكثر تحديدًا ، إنها أداة لتوفير معلومات دقيقة حول دراسة البروتينات الفردية و mRNAs الخاصة بها. في سياق دراسة درجة ترجمة mRNA معين ، فإن تقنية التنميط المتعدد الجوانب أمر حيوي. هنا ، يمكن التحقق من التسلسل 3 'و 5' من mRNA مع الإشارة إلى تأثيرها على كمية mRNA المنتجة ومستوى الترجمة.
ما هو التنميط الريبوسوم؟
التنميط الريبوسوم هي تقنية تحلل سلوك الريبوسوم فيما يتعلق بـ mRNA أثناء الترجمة. تم العثور على هذه التقنية وتطويرها بواسطة Joan Steitz و Marilyn Kozak. في وقت لاحق تم تطوير هذه التقنية من قبل عالمين ، نيكولاس وجوناثان ، بالاشتراك مع تسلسل الجيل التالي ، مما أدى إلى تطوير تقنيات مختلفة ذات صلة مثل منهجية تنقية تقارب الريبوسوم (TRAP).
الشكل 02: تسلسل الريبوسوم
يتضمن إجراء التنميط الريبوسوم عزل mRNA ، وإزالة الحمض النووي الريبي غير المرتبط بالريبوسومات ، وفصل mRNA المرتبط بالريبوسومات. بعد هذا الإجراء ، يتم نسخ عزل mRNA عكسيًا ، ويحدث تخليق (كدنا). أخيرًا ، يمكن محاذاة بيانات التسلسل مع ملف التعريف الترجمي لاستنتاج خصائص سلوك الريبوسوم فيما يتعلق بـ mRNA.
يساعد التنميط الريبوسوم العديد من الباحثين على تحديد واستنتاج موقع مواقع بدء الترجمة ، وتكملة إطارات القراءة المفتوحة المترجمة (ORFs) في خلية أو نسيج ، وتوزيع الريبوسومات على الرنا المرسال ، ومعدل ترجمة الريبوسومات.يُعرف التنميط الريبوسوم أيضًا ببصمة الريبوسوم أو تسلسل ريبو.
ما هي أوجه التشابه بين التنميط المتعدد الأبعاد وتنميط الريبوسوم؟
- التنميط المتعدد و الريبوسوم تقنيات بيولوجية جزيئية مهمة في البحث.
- أنها توفر معلومات حول عملية الترجمة.
- توفر كلتا عمليتي التنميط البيانات من خلال تحليل الترجمة.
- هناك حاجة لخبراء محترفين لأداء كلا التقنيتين للحصول على نتائج دقيقة.
- تلعب أدوات المعلوماتية الحيوية دورًا مهمًا في كلا التقنيتين.
ما هو الفرق بين التنميط المتعدد و التنميط الريبوسوم؟
تحليل التنميط Polysome يحلل سلوك الريبوسوم باستخدام كل من الريبوسوم و mRNA (polysome) أثناء الترجمة ، بينما يحلل التنميط الريبوسوم سلوك الريبوسوم فقط باستخدام تسلسل mRNA أثناء الترجمة.وبالتالي ، هذا هو الفرق الرئيسي بين التنميط متعدد السلالات وتنميط الريبوسوم. علاوة على ذلك ، يتضمن التنميط متعدد العناصر تقنيات مثل الطرد المركزي المتدرج الكثافة وقياسات الكثافة الضوئية ، بينما يتضمن التنميط الريبوسوم تقنيات استخراج وتسلسل الرنا المرسال. أيضا ، التنميط الريبوسوم أكثر دقة من التنميط المتعدد.
يعرض الرسم البياني أدناه الاختلافات بين التنميط متعدد السلالات والريبوسوم في شكل جدول للمقارنة جنبًا إلى جنب.
ملخص - التنميط Polysome مقابل التنميط الريبوسوم
الترجمة هي المرحلة الثانية من تخليق البروتين التي تتضمن تحويل المعلومات الموجودة في تسلسل الرنا المرسال إلى تسلسل الأحماض الأمينية. تتطلب هذه العملية قالب mRNA وريبوسومات وأحماض أمينية و tRNA وعوامل أخرى. التنميط متعدد السوم والريبوسوم هما تقنيتان جزيئيتان. يحلل التنميط متعدد العناصر سلوك الريبوسوم باستخدام كل من الريبوسوم و mRNA (متعدد السوم) أثناء الترجمة ، بينما يحلل التنميط الريبوسوم سلوك الريبوسوم فقط باستخدام تسلسل الرنا المرسال أثناء الترجمة.يتضمن التنميط المتعدد الأبعاد تقنيات مثل الطرد المركزي المتدرج الكثافة وقياسات الكثافة الضوئية. يتضمن التنميط الريبوسوم تقنيات مثل استخراج الرنا المرسال وتوليف (كدنا) والتسلسل. لذلك ، هذا يلخص الفرق بين التنميط متعدد الطبقات وتنميط الريبوسوم.
