الفرق الرئيسي - Exome vs Transcriptome
يحتوي الجين على مناطق مشفرة وغير مشفرة بداخله. تُعرف متواليات التشفير باسم exons ، وتُعرف التسلسلات غير المشفرة باسم introns. يمثل تسلسل النوكليوتيدات لإكسونات الجين الشفرة الجينية للجين لتخليق البروتين المحدد. ومن ثم ، تبقى exons في جزيء mRNA. تُعرف منطقة exon الإجمالية للجينوم باسم exome ، وهي جزء مهم من الجينوم. يتم تحويل الكود الجيني للجينات إلى الكود الجيني لجزيء الرنا المرسال ، وهو أمر ضروري لإنتاج البروتين. تُعرف جزيئات الرنا المرسال الكاملة التي تم نسخها في خلية أو مجموعة خلايا في وقت واحد باسم النسخ.الفرق الرئيسي بين exome و transcriptome هو أن exome يمثل تسلسل مناطق exon من الجينوم بينما يمثل transcriptome إجمالي mRNA لخلية أو نسيج في وقت معين.
ما هو Exome؟
تتكون الجينات من exons و introns والتسلسلات التنظيمية. Exons هي مناطق الجينات التي يتم نسخها إلى تسلسل mRNA أثناء النسخ. تتم إزالة الإنترونات والمناطق الأخرى غير المشفرة أثناء النسخ. يحدد تسلسل النوكليوتيدات للإكسونات الكود الجيني للجين الذي يصنع البروتين المحدد الذي يرمز إليه. تبقى exons فقط داخل mRNA للبروتين. تُعرف مجموعة exons في الجينوم باسم exome للكائن الحي. إنه يمثل جزءًا من الجينوم الذي يتم التعبير عنه في الجينات. في البشر ، يمثل الإكسوم 1٪ من الجينوم. إنه جزء ترميز البروتين من الجينوم البشري.
الشكل 01: Exome
ما هو Transcriptome؟
النص عبارة عن مجموعة من جميع النصوص المشفرة للبروتين وغير المشفرة (RNAs) في نسيج معين. يمثل الترنسكريبتوم مجموعة جزيئات الرنا المرسال الكلية التي تعبر عنها الجينات في الخلية أو الأنسجة. يمكن أن يتنوع نص الخلية مع نسخة من نوع خلية آخر. يعتبر الترنسكربيتوم ديناميكيًا أيضًا - فهو يتغير بمرور الوقت استجابةً للمحفزات الداخلية والخارجية. حتى داخل نفس النسيج أو داخل نفس نوع الخلية ، يمكن أن يتغير الترنسكريبتوم بعد بضع دقائق.
يختلف الترنسكريبتوم عن إكسوم الكائن الحي. يتضمن النسخ فقط تسلسلات exome المعبر عنها. على الرغم من أن إكسوم الخلية يظل كما هو ، يختلف الترنسكريبتوم بين الخلايا لأن التعبير الجيني ليس هو نفسه بالنسبة لجميع الخلايا أو الأنسجة. يتم التعبير عن الجينات الأساسية فقط في الخلايا والأنسجة المختلفة.التعبير الجيني هو عملية محددة بنوع النسيج أو الخلية. يتم تنظيمه من خلال عوامل مختلفة بما في ذلك العوامل البيئية. لذلك ، يمكن أن يختلف الترنسكريبتوم باختلاف الظروف البيئية الخارجية.
يتم استخدام Transcriptome كمقدمة لدراسات البروتينات. جميع البروتينات مشتقة من تسلسل الرنا المرسال. يمكن أن تؤدي التعديلات التحويلية إلى تغييرات في البروتينات. ومع ذلك ، يوفر الترنسكريبتوم معلومات أساسية مهمة للدراسات البروتينية.
الشكل 02: نسخة من الخلايا الجذعية الجنينية
ما هو الفرق بين Exome و Transcriptome؟
Exome مقابل Transcriptome |
|
| Exome هو مجموعة منطقة ترميز البروتين للجينات. | Transcriptome هي مجموعة من جميع نسخ RNA بما في ذلك mRNA. |
| نموذج | |
| تمت دراسة Exome باستخدام عينة الحمض النووي. | تمت دراسة الترنسكريبتوم باستخدام عينة من الحمض النووي الريبي. |
| طريقة الدراسة | |
| تسلسل الإكسوم الكامل هو طريقة دراسة الإكسوم | تسلسل الحمض النووي الريبي هو طريقة دراسة النسخ. |
ملخص - Exome vs Transcriptome
Exons هي تسلسلات ترميز الجينات وتحدد تسلسل mRNA للبروتينات. تُعرف مجموعة تسلسلات الترميز هذه (exons) باسم exome للكائن الحي. يتم نسخ الجينات إلى جزيئات mRNA قبل صنع البروتينات. تُعرف جزيئات الرنا المرسال الكلية للخلية أو الأنسجة في أي وقت معين باسم الترانسكريبتوم.يمثل الترنسكريبتوم الجينات التي يتم التعبير عنها بنشاط في mRNA في أي وقت. الترنسكريبتوم هو نوع خاص بالخلية والأنسجة ويؤثر على الظروف البيئية. هذا هو الفرق بين exome و transcriptome.
