الفرق الرئيسي - تسلسل Exome مقابل RNA
تسلسل الحمض النووي هو التقنية التي تحدد ترتيب النيوكليوتيدات في جزء معين من الحمض النووي أو الحمض النووي الريبي للكائن الحي. يعتبر التسلسل مهمًا في تحديد تركيبة DNA و RNA للخلية وتمييز بعض الجينات التي ترمز للبروتينات الوظيفية ؛ وبالتالي ، يمكن استخدام التسلسل لفهم طفرات هذه الجينات والتعبيرات الجينية. طريقة Sanger Sequencing أو طرق التسلسل من الجيل التالي الأكثر تقدمًا هي طرق التسلسل المستخدمة بشكل شائع. تسلسل Exome هو تسلسل مجموعة كاملة من exons أو مناطق DNA المشفرة الموجودة في كائن حي بينما تسلسل RNA هو إجراء تسلسل للأحماض النووية الريبية (RNA).هذا هو الفرق الرئيسي بين تسلسل exome و RNA.
ما هو تسلسل إكسوم؟
Exome هو مجموعة فرعية من الجينوم الذي يتكون من جينات الترميز لكائن حي معين. تتم تسمية جينات الترميز باسم exons ويتم نسخها إلى mRNA ثم تُترجم إلى تسلسل الأحماض الأمينية. أثناء تعديلات ما بعد النسخ ، تزيل آلية تضفير الحمض النووي الريبي في حقيقيات النوى الإنترونات (المناطق غير المشفرة) ، وتبقى الإكسونات. هناك طريقتان رئيسيتان يتم من خلالهما إجراء تسلسل exome: يعتمد على الحل ويعتمد على المصفوفة.
في تسلسل الإكسوم القائم على المحلول ، يتم تجزئة عينات الحمض النووي باستخدام إما إنزيمات تقييدية أو طريقة ميكانيكية وتحريفها بالحرارة. في هذه التقنية ، تُستخدم مجسات قليل النوكليوتيد الحيوي (الطعوم) للتهجين الانتقائي مع المناطق المستهدفة في الجينوم. تُستخدم حبات الستربتافيدين المغناطيسية لخطوة الربط. يتبع الربط خطوة الغسيل حيث يتم غسل التسلسلات غير المقيدة وغير المستهدفة.ثم يتم تضخيم الأهداف المحددة باستخدام تفاعل سلسلة البوليميراز (PCR) ثم يتم ترتيبها باستخدام تسلسل Sanger أو تقنيات تسلسل الجيل التالي.
الشكل 01: تسلسل إكسوم
الطريقة القائمة على المصفوفة تشبه أيضًا الطريقة القائمة على الحل ، باستثناء أنه يتم التقاط شظايا الحمض النووي في مصفوفة دقيقة ، ثم تتبع خطوات الربط والغسيل قبل التسلسل.
يستخدم تسلسل Exome في العديد من التطبيقات مثل التشخيص الجيني للأمراض ، في العلاج الجيني ، في تحديد العلامات الجينية الجديدة ، في الزراعة لتحديد السمات الزراعية المفيدة المختلفة وفي إجراءات تربية النباتات.
ما هو تسلسل الحمض النووي الريبي؟
يعتمد تسلسل الحمض النووي الريبي على النسخ ، وهي النصوص الكاملة للخلية.تتمثل الأهداف الرئيسية لتسلسل الحمض النووي الريبي في فهرسة جميع أنواع النسخة ، بما في ذلك الرنا المرسال ، والحمض النووي الريبي غير المشفر ، والحمض النووي الريبي الصغير ، لتحديد بنية نسخ الجينات وتحديد مستويات التعبير لكل نسخة أثناء التطوير. أثناء تسلسل الحمض النووي الريبي ، تم استخدام تقنيات التهجين (التي كانت عبارة عن DNA تكميلي مشتق من متواليات mRNA ناضجة) في البداية للتسلسل. في الوقت الحاضر ، يتم استخدام تقنية أكثر دقة ومتقدمة من خلال وضع تسلسل الحمض النووي الريبي.
الشكل 02: تسلسل الحمض النووي الريبي
في تسلسل الحمض النووي الريبي ، يتم تحويل عينة من الحمض النووي الريبي والتي يمكن أن تكون مجموع الحمض النووي الريبي أو الحمض النووي الريبي المجزأ إلى الحمض النووي التكميلي (كدنا) باستخدام النسخ العكسي ، ويتم إعداد مكتبة (كدنا). يتم إرفاق كل جزء (كدنا) بالمحولات على كلا الجانبين (تسلسل نهاية الزوج) أو على جانب واحد (تسلسل طرف واحد).يتم تسلسل هذه التسلسلات ذات العلامات باستخدام تسلسل Sanger أو الجيل التالي ، مثل تسلسل exome.
ما هي أوجه التشابه بين تسلسل Exome و RNA؟
- يمكن استخدام شظايا مختصرة قصيرة أو مجموعة كاملة من DNA / RNA لتسلسل Exome أو RNA.
- يتم حفظ الأجزاء المتسلسلة في المكتبات.
- يمكن استخدام تسلسل Sanger أو تسلسل الجيل التالي.
- كلاهما طريقتان في التسلسل المختبري.
- يمكن تحديد الأجزاء المتسلسلة بعلامات الفلورسنت.
ما هو الفرق بين تسلسل Exome و RNA؟
تسلسل Exome مقابل RNA |
|
| تسلسل Exome هو تسلسل المجموعة الكاملة من exons أو مناطق DNA المشفرة الموجودة في الكائن الحي. | يشير تسلسل الحمض النووي الريبي إلى إجراء تسلسل الأحماض النووية الريبية (RNA) ؛ النص. |
| نموذج البدء | |
| الحمض النووي الجينومي هو عينة البداية لتسلسل إكسوم. | RNA هي عينة البداية لتسلسل الحمض النووي الريبي. |
| التركيب | |
| يحتوي هذا فقط على مناطق تشفير من إجمالي الحمض النووي المعروف باسم Exons | هذا يحتوي على RNA-mRNA / نسخة. |
| التسلسل | |
| هناك طريقتان رئيسيتان لتسلسل exome ؛ التقنيات القائمة على الحلول والمصفوفة. | يتم إجراء تسلسل الحمض النووي الريبيعن طريق إعداد مكتبة (كدنا) عن طريق استخراج إجمالي الحمض النووي الريبي أو الحمض النووي الريبي المجزأ. |
ملخص - تسلسل Exome مقابل RNA
Exome هي مجموعة كاملة من مناطق الترميز للكائن الحي ، وتُعرف التقنيات المستخدمة في تحديد الترتيب الدقيق للنيوكليوتيدات في Exome باسم تسلسل exome. تسلسل الحمض النووي الريبي هو التقنية المستخدمة في تحديد ترتيب النيوكليوتيدات للحمض النووي الريبي للكائن الحي. هذا هو الفرق بين تسلسل exome و RNA.
تنزيل نسخة PDF من تسلسل Exome مقابل RNA
يمكنك تنزيل نسخة PDF من هذه المقالة واستخدامها للأغراض غير المتصلة بالإنترنت وفقًا لملاحظة الاقتباس. يرجى تنزيل نسخة PDF هنا الفرق بين تسلسل Exome و RNA
