الاختلاف الرئيسي بين التشابه والهوية في محاذاة التسلسل هو أن التشابه هو التشابه (التشابه) بين تسلسلين بالمقارنة بينما الهوية هي عدد الأحرف التي تتطابق تمامًا بين تسلسلين مختلفين.
المعلوماتية الحيوية هي مجال علمي متعدد التخصصات يتضمن أساسًا البيولوجيا الجزيئية وعلم الوراثة وعلوم الكمبيوتر والرياضيات والإحصاء. تعد محاذاة التسلسل مصطلحًا رئيسيًا في المعلوماتية الحيوية. إنه الإجراء الذي يتم فيه ترتيب تسلسل الحمض النووي أو الحمض النووي الريبي أو البروتين لتحديد مناطق التشابه التي تنتج عن علاقة وظيفية أو هيكلية أو تطورية بين المتواليات.في نهاية المحاذاة ، سيتم تقديمها كصفوف داخل مصفوفة. من أجل محاذاة الأحرف المتطابقة في الألوان المتتالية ، توجد فجوات مدرجة بين المخلفات.
ما هو التشابه؟
التشابه في محاذاة التسلسل هو التشابه بين تسلسلين عند المقارنة. هذه الحقيقة تعتمد على هوية المتواليات. يصور التشابه إلى أي مدى يتم محاذاة البقايا. وبالتالي ، تحتوي التسلسلات المتشابهة على خصائص متشابهة. في المعلوماتية الحيوية ، التشابه هو أداة لتقييم التشابه بين بروتينين.
الشكل 01: التشابه في محاذاة التسلسل
هناك خطوتان رئيسيتان لتسلسل عملية المحاذاة. الخطوة الأولى هي المحاذاة الزوجية ، مما يساعد على إيجاد المحاذاة المثلى بين تسلسلين (بما في ذلك الفجوات) باستخدام خوارزميات مثل BLAST و FastA و LALIGN.تجد خوارزمية المطابقة الحد الأدنى لعدد عمليات التحرير ؛ in-dels والبدائل من أجل محاذاة أحد التسلسلات مع التسلسل الآخر. بعد المحاذاة الزوجية ، من الضروري الحصول على معلمتين كميتين من كل مقارنة زوجية. هم الهوية والتشابه
ما هي الهوية؟
الهوية في محاذاة التسلسل هي عدد الأحرف التي تتطابق تمامًا بين تسلسلين مختلفين. ومن ثم ، لا تؤخذ الثغرات بعين الاعتبار عند تقييم الهوية. يعتبر القياس علاقيًا بالتسلسل الأقصر بين التسلسلين. إنه يعني بشكل كبير أن لها تأثيرًا حيث لا تكون هوية التسلسل متعدية. إذا كانت X=Y و Y=Z ، فإن X لا تساوي بالضرورة Z. يتم استنتاج هذا من حيث قياس مسافة الهوية.
الشكل 02: الهوية في محاذاة التسلسل
على سبيل المثال ، يحتوي X على تسلسل AAGGCTT ، ويحتوي Y على تسلسل AAGGC و Z يحتوي على تسلسل AAGGCAT. التطابق بين X و Y هو 100٪ {5 نيوكليوتيدات متطابقة / دقيقة [طول (س) ، طول (ص)]}. الهوية بين Y و Z هي أيضًا 100٪. لكن الهوية بين X و Z هي 85٪ فقط {(6 نيوكليوتيدات متطابقة / 7)}.
ما هي أوجه التشابه بين التشابه والهوية في محاذاة التسلسل؟
- كلا التشابه والهوية هما مصطلحان نستخدمهما في محاذاة التسلسل.
- أيضًا ، يشيرون إلى التشابه بين التسلسلين.
- علاوة على ذلك ، نعبر عنها كقيمة مئوية.
ما هو الفرق بين التشابه والهوية في محاذاة التسلسل؟
يشير التشابه في المحاذاة إلى التشابه بين تسلسلين عند مقارنته بينما تخبر الهوية في محاذاة التسلسل عدد الأحرف التي تتطابق تمامًا بين تسلسلين مختلفين.لذلك ، هذا هو الفرق الرئيسي بين التشابه والهوية في محاذاة التسلسل.
ملخص - التشابه مقابل الهوية في محاذاة التسلسل
تساعد محاذاة التسلسل في تحديد مناطق التشابه في الحمض النووي أو الحمض النووي الريبي أو البروتين الناتج عن علاقة وظيفية أو هيكلية أو تطورية بين التسلسلات. ومن ثم ، فإن التشابه والهوية هما مصطلحان رئيسيان في سياق محاذاة التسلسل. يتمثل الاختلاف الرئيسي بين هذين المصطلحين في أن التشابه هو التشابه بين تسلسلين في المقارنة بينما الهوية هي عدد الأحرف التي تتطابق تمامًا بين تسلسلين مختلفين. وبالتالي ، هذا هو ملخص الفرق بين التشابه والهوية في محاذاة التسلسل.
