الفرق الرئيسي بين اللولب الحلقي الحلزوني واللولب الحلزوني هو أن اللولب الحلزوني الحلزوني يتوسط تباعد البروتين بينما اللولب بدوره اللولب ينظم التعبير الجيني من خلال ربط الحمض النووي.
شكل البروتين هو تسلسل محفوظ قصيرًا مرتبط بوظائف مميزة للحمض النووي. يرتبط بشكل أساسي بموقع هيكلي خاص بوظيفة كيميائية أو بيولوجية فريدة. تحتوي هذه الأشكال على مناطق صغيرة من الهياكل ثلاثية الأبعاد للأحماض الأمينية مع جزيئات بروتينية مختلفة. عادة ، تحتوي الزخارف الفردية على عدد قليل من العناصر. يحتوي اللولب الحلقي اللولبي واللولب الحلزوني على ثلاثة عناصر.تشتمل الأشكال الهيكلية للبروتين على حلقات بأطوال متفاوتة وبنى غير محددة.
ما هو اللولب الحلقي الحلزوني؟
اللولب الحلزوني الحلزوني (HLH) هو نموذج هيكلي للبروتين يحدد واحدة من أكبر عائلات عوامل النسخ المضاعفة. تحتوي عوامل النسخ هذه على بقايا من الأحماض الأمينية لتسهيل آلية ربط الحمض النووي ، وهي قاتمة. يحتوي الشكل البنيوي للبروتين على حلزوني ألفا ، وهما متصلان بواسطة حلقة. يظهر حلزون واحد أصغر من اللولبتين ، وتسمح مرونة الحلقة بتقسيم اللولب عن طريق التعبئة والطي على حلزون آخر. عادةً ما يحتوي اللولب الذي يظهر أكبر على مناطق ربط الحمض النووي. ترتبط بروتينات HLH بتسلسل إجماع يُعرف باسم E-box. تسلسل الإجماع هو ترتيب محسوب يحتوي على بقايا النيوكليوتيدات أو الأحماض الأمينية. E-box هو عنصر يستجيب للحمض النووي في بعض حقيقيات النوى والذي يعمل كموقع ربط للبروتين وينظم التعبير الجيني.
الشكل 01: شكل الحلزون الحلزوني
عوامل النسخ HLH ضرورية للتطور ونشاط الخلية. تنتمي بروتينات HLH بشكل أساسي إلى ست مجموعات ، يشار إليها من الأحرف A إلى F. عوامل النسخ المدرجة في كل مجموعة هي:
المجموعة أ: MyoD و Myf5 و Beta2 / NeuroD1 و Scl و p-CaMK و NeuroD و Neurogenins
المجموعة B: MAX و C-Myc و N-Myc و TCF4
المجموعة C: AhR و BMAL-1-CLOCK و HIF و NPAS1 و NPAS3 و MOP5
المجموعة د ؛ EMC
المجموعة E: HEY1 و HEY2
المجموعة F: EBF1
نظرًا لأن معظم عوامل النسخ لـ HLH غير متجانسة ، غالبًا ما ينظمها dimerization.
ما هو Helix-Turn-Helix؟
Helix-turn-helix (HTH) هو نموذج هيكلي للبروتين قادر على ربط الحمض النووي. يتم تنظيم كل مونومر باستخدام حلزوني ألفا وينضم إليهما بواسطة حبلا قصير من الأحماض الأمينية. هذا يرتبط بأخدود في حلزون الحمض النووي. عادة ما تنظم أشكال HTH التعبير الجيني. يتم التعرف على HTH وربطه بالحمض النووي بواسطة حلزونات ألفا. أحد الحلزون يحتل الطرف N بينما الآخر في الطرف C. في معظم السيناريوهات ، يقوم اللولب بالتعرف على الحمض النووي. لذلك ، يُعرف باسم حلزون التعرف. يحدث الارتباط بالأخدود في الحمض النووي من خلال سلسلة من تفاعلات Van der Waals والروابط الهيدروجينية مع تعرض القواعد. يعمل الحلزون الآخر على استقرار تفاعل البروتين والحمض النووي ولا يلعب دورًا رئيسيًا في التعرف عليه. ومع ذلك ، فإن حلزون التعرف واللولب المتبقي لهما اتجاه مماثل.
الشكل 02: اللولب الدوراني لعائلة TetR
يتم تصنيف HTH وفقًا للهيكل والترتيبات المكانية للحلزونات. الأنواع الرئيسية هي ثنائي حلزوني وثلاثي حلزوني ورباعي حلزوني وجناح HTH. النوع Di-helical هو أبسط نوع به حلزون ومجال بروتين قابل للطي مستقل. تم العثور على نوع ثلاثي حلزوني في المنشط النسخي Myb. يحتوي النوع الرباعي الحلزوني على حلزون طرفي C إضافي. أخيرًا ، يتكون HTH المجنح من 3 حزم حلزونية و 3 أو 4 ورقة بيتا ستراند.
ما هي أوجه التشابه بين Helix-Loop-Helix و Helix-Turn-Helix؟
- Helix-loop-helix و helix-turn-helix هي عناصر هيكلية بروتينية.
- كلاهما يحتوي على قاسم مشترك في عوامل النسخ القاعدية والمحددة.
- هم موجودون في حقيقيات النوى.
ما هو الفرق بين Helix-Loop-Helix و Helix-Turn-Helix؟
الحلزون الحلزوني يتوسط تباعد البروتين ، بينما اللولب بدوره اللولبي ينظم التعبير الجيني من خلال ربط الحمض النووي. وبالتالي ، هذا هو الفرق الرئيسي بين اللولب الحلزوني الحلزوني واللولب الحلزوني. إلى جانب ذلك ، يحتوي HLH على بعض الجينات الأولية للجينات والجينات المشاركة في عوامل النسخ المشفر التمايز بينما يحتوي HTH على العديد من الجينات المثلية التي ترمز لعوامل النسخ. علاوة على ذلك ، يتكون اللولب الحلزوني الحلزوني بشكل أساسي من حلزونات ألفا مرتبطة بحلقة ، بينما يتكون الحلزون الحلزوني بشكل أساسي من حلقات متصلة بحامل قصير من الأحماض الأمينية يشكل أخدودًا.
يعرض الرسم البياني أدناه الاختلافات بين اللولب الحلقي الحلزوني واللولب الحلزوني في شكل جدول للمقارنة جنبًا إلى جنب.
ملخص - Helix-Loop-Helix vs Helix-Turn-Helix
شكل البروتين هو تسلسل محفوظ قصيرًا مرتبط بوظائف مميزة للحمض النووي.اللولب الحلقي الحلزوني واللولب الحلزوني اللولبي هما نوعان من الأشكال الهيكلية للبروتين. يتمثل الاختلاف الرئيسي بين اللولب الحلقي الحلزوني واللولب الحلزوني في أن اللولب الحلزوني الحلزوني يتوسط تباعد البروتين ، بينما ينظم اللولب الحلزوني اللولب التعبير الجيني من خلال ربط الحمض النووي. HLH هو نموذج هيكلي للبروتين يحدد واحدة من أكبر عائلات عوامل النسخ المضاعفة. يحتوي الشكل البنيوي للبروتين على حلزوني ألفا ، وهما متصلان بواسطة حلقة. HTH هو نموذج هيكلي للبروتين قادر على ربط الحمض النووي. يتم تنظيم كل مونومر باستخدام حلزوني ألفا ، ويتم ربطه بواسطة حبلا قصير من الأحماض الأمينية ويرتبط بأخدود في حلزون الحمض النووي. إذن ، هذا يلخص الفرق بين اللولب الحلزوني الحلزوني واللولب الحلزوني.
