الفرق الرئيسي بين dNTP و ddNTP هو أن dNTP أو deoxyribonucleotides هي اللبنات الأساسية للحمض النووي ولديها مجموعة 3ʹ-OH على بنية سكر البنتوز بينما ddNTP أو dideoxynucleoside triphosphates عبارة عن نيوكليوتيدات تفتقر إلى مجموعة 3ʹ-OH وهي تُستخدم في تقنية تسلسل Sanger dideoxy DNA لإنتاج تسلسلات DNA مختلفة الطول.
dNTP و ddNTP هي نيوكليوتيدات. يشير dNTP إلى نيوكليوتيدات الديوكسيريبوز. هم اللبنات الأساسية للحمض النووي. تستخدم dNTPs لتوليف الحمض النووي. من ناحية أخرى ، يشير dNTP إلى dideoxynucleoside triphosphates. يتم استخدامها في تسلسل Sanger لإنهاء تخليق الحمض النووي بأطوال مختلفة.يفتقرون إلى مجموعة OH في 3ʹ موقف. الهيدروجين موجود في الموضع 3ʹ بدلاً من مجموعة OH. لذلك ، فإن ddNTPs غير قادرة على تكوين رابطة فسفودايستر مع النيوكليوتيدات التالية. dNTP قادر على تنفيذ تخليق الحمض النووي ، بينما ddNTP قادر على إنهاء بلمرة الحمض النووي.
ما هو dNTP؟
dNTP تعني نيوكليوتيد deoxyribose أو deoxyribonucleotide. إنه لبنة بناء الحمض النووي. هناك أربعة أنواع من dNTPs. هم dATP و dTTP و dCTP و dGTP. تم تسميتها وفقًا لقواعد البيورين أو البيريميدين النيتروجينية: Adenine (A) ، Guanine (G) ، Thymine (T) و Cytosine (C).
الشكل 01: dNTP
الأدينين والجوانين هما قواعد بيورين بينما الثايمين والسيتوزين هما قواعد بيريميدين. السكر البنتوز لـ dNTP هو deoxyribose.هناك أيضا مجموعة الفوسفات. لذلك ، يتكون dNTP من ثلاثة مكونات: قاعدة نيتروجينية وسكر ديوكسيريبوز ومجموعة فوسفات. تتحد dNTPs هذه مع بعضها البعض عبر روابط phosphodiester. في dNTPs ، توجد مجموعة OH مرتبطة بالموضع 3ʹ من سكر البنتوز المطلوب لتشكيل رابط مع مجموعة الفوسفات المرتبطة بكربون 5ʹ من سكر النوكليوتيد التالي. نظرًا لأن جميع dNTPs تحتوي على مجموعة 3ʹ -OH ، فهي قادرة على تصنيع وتمديد خيوط الحمض النووي. وبالتالي ، يعمل dNTP كوحدة التكرار الأساسية للحمض النووي والمادة الكيميائية للجينات. يستمر تركيب الحمض النووي دائمًا من 5 إلى 3 درجات.
ما هو DdNTP؟
تسلسل سانجر هو أسلوب تسلسل الحمض النووي من الجيل الأول تم تطويره بواسطة فريدريك سانجر وكلياته في عام 1977. يُعرف أيضًا باسم تسلسل إنهاء السلسلة أو تسلسل Dideoxy نظرًا لأن المبدأ الأساسي لهذه الطريقة هو إنهاء السلسلة باستخدام ثنائي أكسيد النوكليوزيد ثلاثي الفوسفات (ddNTPs). ddNTPs هي نيوكليوتيدات تستخدم في تسلسل سانجر.يعتمد تسلسل سانجر على الدمج الانتقائي لـ ddNTPs وإنهاء تخليق الحمض النووي أثناء تكرار الحمض النووي في المختبر. تخصص ddNTPs هو أنها تفتقر إلى مجموعة 3ʹ-OH على سكر البنتوز لمواصلة تكوين رابطة الفوسفات بين مجموعة الفوسفات من 5 في النوكليوتيدات المجاورة. ومن ثم ، بمجرد توصيل ddNTP بالحبل الممتد ، يتوقف استطالة السلسلة وينتهي من تلك النقطة. تعمل ddNTPs كمثبطات استطالة السلسلة لبوليميراز الحمض النووي أثناء طريقة تسلسل سانجر.
الشكل 02: ddNTP
هناك أربعة ddNTPs: ddATP و ddCTP و ddGTP و ddTTP المستخدمة في تسلسل Sanger. توقف هذه النيوكليوتيدات عملية تكرار الحمض النووي عندما يتم دمجها في خيط الحمض النووي المتنامي. نتيجة لذلك ، ينتج عن تسلسل Sanger أطوال متفاوتة من الحمض النووي القصير.يستخدم الرحلان الكهربائي للهلام الشعري لتنظيم خيوط الحمض النووي القصيرة هذه حسب أحجامها على مادة هلامية. يتم تصنيف ddNTPs بشكل إشعاعي أو فلوري بألوان مختلفة لسهولة تحليل تسلسل الحمض النووي. من خلال تحليل الهلام ، يمكن تحديد تسلسل النوكليوتيدات لشريط الحمض النووي غير المعروف.
ما هي أوجه التشابه بين dNTP و DdNTP؟
- يتم استخدام كل من dNTP و ddNTP في تسلسل Sanger.
- هناك أربعة أنواع من dNTPs و ddNTPs.
- تتكون من ثلاثة مكونات: قاعدة نيتروجينية ، سكر ديوكسيريبوز ومجموعات فوسفات.
ما هو الفرق بين dNTP و DdNTP؟
dNTP هو واحد من أربعة أنواع من deoxyribonucleotides التي تشكل اللبنات الأساسية للحمض النووي. ddNTP هو أحد الأنواع الأربعة من ثلاثي فوسفات ثنائي أوكسي ريبونوكليوزيد المستخدم في تقنية تسلسل سانجر. يحتوي dNTP على مجموعة 3ʹ-OH على سكر البنتوز بينما يفتقر ddNTP إلى مجموعة 3ʹ-OH على سكر البنتوز.وبالتالي ، هذا هو الفرق الرئيسي بين dNTP و ddNTP. علاوة على ذلك ، تنفذ dNTPs بلمرة الحمض النووي بينما تنهي ddNTPs بلمرة الحمض النووي. ومن ثم ، يعد هذا فرقًا رئيسيًا آخر بين dNTP و ddNTP.
يسرد مخطط المعلومات أدناه الاختلافات بين dNTP و ddNTP في شكل جدول.
ملخص - dNTP مقابل DdNTP
dNTPs العادي هي اللبنات الأساسية للحمض النووي بينما ddNTPs هي نيوكليوتيدات تستخدم في تقنية تسلسل سانجر. يحتوي dNTP على 3ʹ-OH بينما يفتقر ddNTP إلى 3ʹ-OH. وبالتالي ، هذا هو الفرق الرئيسي بين dNTP و ddNTP. علاوة على ذلك ، يمكن لـ dNTP توليف خيط DNA بينما يمكن لـ ddNTP إنهاء بلمرة الحمض النووي. لذلك ، يتم استخدام ddNTPs في تسلسل Sanger من أجل إنتاج خيوط DNA مختلفة بأطوال متفاوتة. أثناء تسلسل Sanger ، يتم تضمين كل من dNTP و ddNTP.
