يعتمد الاختلاف الرئيسي بين QTL و GWAS على نوع التسلسلات المستخدمة في التحليل. تستخدم QTL مواقع جينات الارتباط لتحليل السمات المظهرية المرتبطة بالوراثة متعددة الجينات بينما يستخدم GWAS تسلسل الجينوم الكامل لتحليل تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة لحالة معينة.
تلعب خرائط QTL و GWAS دورًا مهمًا في التحليلات الجينية للسمات المختلفة. علاوة على ذلك ، فهي مهمة في تحليل الحالات المرضية المختلفة ذات المسببات المرضية غير المعروفة. بالإضافة إلى ذلك ، يلعب التسلسل دورًا رئيسيًا في كلا التقنيتين. يمكن أيضًا أن تقترن هذه التقنيات بتقنيات أخرى عالية الإنتاجية لزيادة الدقة والدقة.
ما هي QTL؟
QTL تعني تركيز السمات الكمية. إنها منطقة من الحمض النووي مرتبطة بسمة نمطية. بشكل عام ، يؤدي QTL إلى تأثيرات متعددة الجينات. يختلف توزيع QTLs ، ويقترح عدد QTLs درجة التباين في سمة نمطية معينة. علاوة على ذلك ، فإنها عادةً ما ترمز للسمات المستمرة الكامنة وراءها وليست السمات المنفصلة.
عند تحديد مناطق QTL ، من المهم ترتيب منطقة QTL معينة. علاوة على ذلك ، لتسهيل التحقيقات والبحث ، يتم إجراء تسلسل وتخزين بيانات التسلسل لمناطق QTL المشتركة بمشاركة المعلوماتية الحيوية. نسمي هذه التقنية رسم خرائط QTL. في وقت لاحق ، تتراكم قاعدة البيانات مع تسلسل منطقة QTL.
الشكل 01: مسح QTL
علاوة على ذلك ، تعتمد تطبيقات تسلسل QTL بشكل أساسي على أداة BLAST ، حيث يمكن تحديد تشابه التسلسل. من المهم في استنتاج العلاقات بين الكائنات الحية. علاوة على ذلك ، من المهم في تحديد مدى تعقيد النمط الظاهري متعدد الجينات. كما أنه يحدد تطور سمة معينة.
في الوقت الحاضر ، يتم دمج تحليل QTL مع تقنيات أخرى عالية الإنتاجية مثل المصفوفات الدقيقة للحمض النووي. هذا مهم في تحليل التعبير عن النمط الظاهري. في الوقت الحالي ، يهتم العلماء كثيرًا بتطوير قاعدة بيانات QTL نظرًا لأن مناطق QTL مسؤولة عن العديد من السمات المهمة للأنواع المختلفة.
ما هو GWAS؟
GWAS تعني دراسة ارتباط الجينوم الواسع. كما يشير إلى دراسات ارتباط الجينوم الكامل. تركز هذه الدراسات بشكل رئيسي على الدراسات القائمة على الملاحظة. يحلل المتغيرات الجينية لأفراد مختلفين مرتبطة عادة بسمة معينة. علاوة على ذلك ، فإن الجينوم بأكمله مهم لتحليل GWAS.
الشكل 02: GWAS
GWAS هي أداة مهمة في تحليل أشكال النوكليوتيدات المفردة المرتبطة بحالات مرضية مختلفة. هذه أيضًا دراسة مقارنة لمختلف أشكال النوكليوتيدات المفردة عبر مجموعة واسعة من السكان. بالإضافة إلى ذلك ، فإن عينة الدراسة من GWAS عالية جدًا ؛ ومن ثم ، فإنه يأخذ أيضًا شكل دراسة أترابية مقطعية.
علاوة على ذلك ، أجريت أول دراسة GWAS فيما يتعلق باحتشاء عضلة القلب وتحليل الجينات المرتبطة باحتشاء عضلة القلب. في الوقت الحاضر ، تلعب GWAS دورًا مهمًا في تحديد الخلفية الجينية للأمراض المعقدة ذات المسببات المرضية غير المعروفة.
ما هي أوجه التشابه بين QTL و GWAS؟
- يعتمدون على بيانات تسلسل الحمض النووي للتحليل.
- كلاهما مرتبط بالخلفيات الجينية لشخصيات مختلفة.
- علاوة على ذلك ، فهي تتطلب أدوات المعلوماتية الحيوية لاستنتاج وتفسير النتائج.
- يتم إجراؤها على عدد كبير من السكان.
ما هو الفرق بين QTL و GWAS؟
يحلل QTL الصفات المظهرية المرتبطة بالميراث متعدد الجينات باستخدام مواضع الجينات المرتبطة بينما يحلل GWAS الأشكال المتعددة للنيوكليوتيدات المفردة لحالة معينة باستخدام تسلسل الجينوم الكامل. وبالتالي ، هذا هو الفرق الرئيسي بين QTL و GWAS. رسم خرائط QTL هو نسبيًا تقنية أقل تعقيدًا من GWAS لأنها تتطلب تسلسل الجينوم الكامل.
الرسم البياني أدناه يلخص الفرق بين QTL و GWAS في شكل جدول.
ملخص - QTL مقابل GWAS
رسم خرائط QTL و GWAS يلعبان دورًا رئيسيًا في تحديد الخلفية الجينية للسمات المظهرية المختلفة. كما أنها تساعد في تحليل الخلفية الجينية للأمراض المختلفة. رسم خرائط QTL يرسم خرائط جينات الربط المسؤولة عن السمات المستمرة ، ويتضمن أيضًا تعيين جينات الوراثة متعددة الجينات. من ناحية أخرى ، يحدث GWAS مع تحليل الجينوم الكامل لتعدد أشكال النوكليوتيدات الفردية. بالإضافة إلى ذلك ، يحدث هذا عبر عدد أكبر من السكان. وبالتالي ، هذا هو ملخص الفرق بين QTL و GWAS.
