الفرق الرئيسي بين سيرين و ريكومبيناز التيروزين هو أنه في سيرين ريكومبيناز ، سيرين هو الحمض الأميني المحب للنيوكليوفيليك الذي يستخدمه الإنزيم لمهاجمة الحمض النووي أثناء إعادة التركيب الخاص بالموقع ، بينما في التيروزين ريكومبيناز ، التيروزين هو الحمض الأميني نيوكليوفيليك المستخدم بواسطة الإنزيم لمهاجمة الحمض النووي أثناء إعادة التركيب الخاص بالموقع.
إعادة التركيب الخاص بالموقع (إعادة التركيب المحافظ الخاص بالموقع) هو نوع من تقنيات إعادة التركيب الجيني حيث يتم تبادل خيوط الحمض النووي بين الأجزاء التي لها درجة معينة من التماثل المتسلسل. تنظم عمليات إعادة التركيب الخاصة بالموقع عملية إعادة التركيب الخاصة بالموقع.يتم تجميع هذه الإنزيمات في عائلتين كعائلة سيرين recombinase وعائلة التيروزين recombinase. تأتي الأسماء من بقايا الأحماض الأمينية المحبة للنووية المحفوظة الموجودة في الفئتين السابقتين من إعادة التركيب التي تستخدم لمهاجمة الحمض النووي والتي تصبح مرتبطة تساهميًا بها أثناء تبادل الخيوط في إعادة التركيب الخاصة بالموقع.
ما هو Serine Recombinase؟
في طريقة إعادة التركيب الخاصة بالموقع ، يتم قطع تسلسلين قصيرين للحمض النووي ("المواقع المستهدفة") في نقاط محددة في كلا الخيوط ، ويتم إعادة ضم نهايات القطع إلى شركاء جدد. تقنيات إعادة التركيب الخاصة بالموقع هي أدوات جينومية في الهندسة الوراثية تعتمد على إنزيمات recombinase لتحل محل القسم المستهدف من الحمض النووي. تم العثور على العديد من أنظمة إعادة التركيب الخاصة بالموقع لإجراء عمليات إعادة ترتيب الحمض النووي هذه لأغراض مختلفة. لكن كل إنزيمات recombinase تنتمي إلى عائلتين. سيرين ريكومبيناز هو واحد منهم. يمكنهم التوسط في ما يصل إلى ثلاثة أنواع من إعادة ترتيب الحمض النووي: التكامل والاستئصال والانعكاس.
الشكل 01: سيرين ريكومبيناس
تقوم عمليات إعادة التركيب الخاصة بالموقع مثل إعادة التركيب السيرين بإعادة ترتيب الحمض النووي من خلال التعرف على تسلسل الحمض النووي القصير والربط به (الموقع المستهدف) ، حيث تشق العمود الفقري للحمض النووي. في وقت لاحق ، يحدث تبادل حلزوني DNA ويتم إعادة الانضمام إلى خيوط الحمض النووي. في سيرين ريكومبيناز ، السيرين هو الحمض الأميني الذي يستخدمه الإنزيم لمهاجمة الحمض النووي أثناء إعادة التركيب الخاص بالموقع. أثناء انقسام الحمض النووي ، تتشكل رابطة البروتين والحمض النووي عبر تفاعل استرة. يتم استبدال رابطة phosphodiester برابطة phosphoserine بين مجموعة 5’phosphate في موقع الانقسام ومجموعة الهيدروكسيل لبقايا السيرين المحفوظة. تخزن الرابطة الجديدة الطاقة التي تنفق في شق الحمض النووي في الموقع المستهدف.تُستخدم هذه الطاقة لاحقًا لإعادة انضمام الحمض النووي إلى مجموعة هيدروكسيل الديوكسيريبوز المقابلة في الموقع الآخر. أمثلة على recombinases السيرين هي resolvases / invertases السيرين و التكامل سيرين.
ما هو Tyrosine Recombinase؟
التيروزين recombinase هي فئة الإنزيم الأخرى التي تنظم إعادة التركيب المحافظ الخاص بالموقع. كما تم وصفه سابقًا ، يقوم التيروزين recombinase أيضًا بإعادة ترتيب الحمض النووي بنفس الطريقة من خلال التعرف على تسلسل DNA قصير (الموقع المستهدف) والربط به ، حيث يشقون العمود الفقري للحمض النووي. في وقت لاحق ، يتم تبادل اثنين من حلزونات الحمض النووي وإعادة الانضمام إلى خيوط الحمض النووي.
الشكل 02: التيروزين ريكومبيناس
لكن في التيروزين ريكومبيناز ، التيروزين هو الحمض الأميني الذي يستخدمه الإنزيم لمهاجمة الحمض النووي أثناء إعادة التركيب الخاص بالموقع.السمة المشتركة لهذه الفئة هي بقايا التيروزين المحفوظة للنيوكليوفيليك التي تهاجم فوسفات الحمض النووي المقصي لتشكيل ارتباط 3′-فوسفوتيروزين. إعادة التركيب التيروزين (A1) و جمل التيروزين (A2) هي مجموعات الإنزيمات البارزة في عائلة إنزيم التيروزين ريكومبيناز.
ما هي أوجه التشابه بين Serine و Tyrosine Recombinase؟
- هم فئة من إنزيمات recombinase.
- كلاهما ينظم إعادة التركيب الخاص بالموقع.
- إنها بروتينات.
- التفاعل الكيميائي الأساسي هو نفسه لكليهما.
- كلاهما يحفز تفاعلات التحويل.
ما هو الفرق بين Serine و Tyrosine Recombinase؟
في سيرين recombinase ، السيرين هو الحمض الأميني nucleophilic الذي يستخدمه الإنزيم لمهاجمة الحمض النووي أثناء إعادة التركيب الخاص بالموقع. من ناحية أخرى ، في التيروزين ريكومبيناز ، التيروزين هو الحمض الأميني النواة الذي يستخدمه الإنزيم لمهاجمة الحمض النووي أثناء إعادة التركيب الخاص بالموقع.لذلك ، هذا هو الفرق الرئيسي بين سيرين ريكومبيناز والتيروزين. السمة المشتركة لعقار سيرين recombinase هي أنه يشكل رابطة فسفوسرين مع الحمض النووي ، في حين أن التيروزين recombinase يشكل رابطة فسفوتيروزين مع الحمض النووي أثناء عملية إعادة التركيب الخاصة بالموقع.
يسرد الرسم البياني أدناه الاختلافات بين سيرين والتيروزين recombinase في شكل جدول.
-
الفرق بين سيرين وتيروزين ريكومبيناز في شكل جدولي
ملخص - Serine vs Tyrosine Recombinase
يمكن أن يحدث إعادة التركيب بين جزيئات مماثلة من الحمض النووي كما هو الحال في إعادة التركيب المتماثل أو الجزيئات غير المتشابهة كما هو الحال في إعادة التركيب غير المتماثل. إعادة التركيب الخاص بالموقع هو نوع من إعادة التركيب الجيني حيث يتم تبادل خيوط الحمض النووي بين الأجزاء التي لها على الأقل درجة معينة من التماثل المتسلسل.يتم تحفيزه عن طريق إعادة التركيب. يتم تجميع معظم recombinases في عائلتين: سيرين recombinase و tyrosine recombinase. يستخدم Serine recombinase السيرين باعتباره الحمض الأميني nucleophilic لمهاجمة الحمض النووي أثناء عملية إعادة التركيب الخاصة بالموقع. يستخدم Tyrosine recombinase التيروزين باعتباره الحمض الأميني nucleophilic لمهاجمة الحمض النووي أثناء عملية إعادة التركيب الخاصة بالموقع. لذلك ، هذا هو الفرق الرئيسي بين سيرين والتيروزين recombinase.
