الاختلاف الرئيسي بين MLVA و MLST هو أن MLVA يستخدم تعدد الأشكال لتسلسلات الحمض النووي المتكررة جنبًا إلى جنب لتوصيف الأنواع الميكروبية ، بينما يستخدم MLST تعدد الأشكال لتسلسل الحمض النووي للأجزاء الداخلية من جينات التدبير المنزلي المتعددة لتوصيف الأنواع الميكروبية.
تستخدم الكتابة الجرثومية عادة لتحديد مصدر وطرق العدوى. يؤكد أو يستبعد تفشي المرض. يتتبع التصنيف الميكروبي أيضًا انتقال مسببات الأمراض المرتبطة بالرعاية الصحية ويتعرف على السلالات الفتاكة. علاوة على ذلك ، يقوم التصنيف الميكروبي بتقييم فعالية تدابير التحكم في الأنواع الميكروبية المسببة للأمراض. MLVA و MLST هما طريقتان بيولوجيتان جزيئيتان تستخدمان في الكتابة الميكروبية.
ما هو MLVA؟
تحليل VNTR لمواقع متعددة (MLVA) هو طريقة بيولوجية جزيئية تستخدم تعدد الأشكال لتسلسل الحمض النووي المتكرر بالترادف لتمييز الأنواع الميكروبية. إنها طريقة تستخدم للتحليل الجيني لأنواع ميكروبية معينة.
خلال الخطوة الأولى من MLVA ، يتم تضخيم كل موضع VNTR مستهدف بواسطة PCR مع بادئات خاصة بالمنطقة المحيطة. ثم يتم فصل الأجزاء التي تم الحصول عليها عن طريق الرحلان الكهربائي على جهاز التسلسل الشعري. يسمح التنميط الجيني لكل موقع والنتائج المجمعة من كل عينة بتوصيف كائن حي دقيق معروف نوعه. كما يسمح بتحديد الأنواع الفرعية من خلال كتابة الأليل والمقارنة بقواعد بيانات MLVA.
الشكل 01: MLVA
طريقة MLVA هذه أكثر انتقائية من طريقة MLST. علاوة على ذلك ، لا تتطلب طريقة MLVA خطوة تسلسل الحمض النووي. وبالتالي ، فإنه يجعل من الممكن التمييز بين الأنواع الفرعية القريبة أو الأنواع المستنسخة.
ما هو MLST؟
الكتابة المتسلسلة متعددة البؤرة (MLST) هي تقنية تستخدم تعدد الأشكال لتسلسل الحمض النووي للأجزاء الداخلية لجينات التدبير المنزلي المتعددة لتوصيف الأنواع الميكروبية. MLST هي تقنية في التحليل الجيني لكتابة مواقع متعددة.
الشكل 02: MLST
هو نوع من الكتابة التسلسلية المستخدمة كأسلوب مرجعي لتمييز السلالات المختلفة من الأنواع الميكروبية. تعتمد هذه الطريقة على تسلسل الجينات التدبير المنزلي.عادةً ما تقوم جينات التدبير المنزلي بتشفير البروتينات الأساسية للعوامل الميكروبية مثل البكتيريا. هذه التسلسلات من جينات التدبير المنزلي لها خصوصية تقديم تعدد أشكال ثابت بمرور الوقت. لذلك ، فإن الاختلافات في تسلسل جينات التدبير المنزلي كافية بما يكفي لتمييز السلالات عن بعضها البعض. علاوة على ذلك ، كان أول مخطط MLST الذي تم تطويره هو Neisseria meningitidis ، العامل المسبب لالتهاب السحايا بالمكورات السحائية وتسمم الدم. منذ تقديمه ، تم استخدام MLST ليس فقط لمسببات الأمراض البشرية ولكن أيضًا لمسببات الأمراض النباتية.
ما هي أوجه التشابه بين MLVA و MLST؟
- MLVA و MLST نوعان من التقنيات البيولوجية الجزيئية المستخدمة في الكتابة الميكروبية.
- يمكن استخدام كلتا الطريقتين لتحليل النشوء والتطور الميكروبي.
- كلا الأسلوبين يعتمدان على تعدد الأشكال الجيني.
- يمكن استخدامها للكشف عن الأمراض البشرية المسببة لمسببات الأمراض الميكروبية.
- كلا التقنيتين يجب أن يقوم بهما علماء الأحياء الجزيئية المهرة.
ما هو الفرق بين MLVA و MLST؟
MLVA هي تقنية تستخدم تعدد الأشكال لتسلسلات الحمض النووي المتكررة جنبًا إلى جنب لتمييز الأنواع الميكروبية. وفي الوقت نفسه ، MLST هي تقنية تستخدم تعدد أشكال تسلسل الحمض النووي للشظايا الداخلية لجينات التدبير المنزلي المتعددة لتوصيف الأنواع الميكروبية. وبالتالي ، هذا هو الفرق الرئيسي بين MLVA و MLST. علاوة على ذلك ، فإن طريقة MLVA أكثر انتقائية من طريقة MLST.
يعرض الرسم البياني أدناه الاختلافات بين MLVA و MLST في شكل جدول للمقارنة جنبًا إلى جنب.
ملخص - MLVA مقابل MLST
MLVA و MLST هما طريقتان بيولوجيتان جزيئيتان تستخدمان في الكتابة الميكروبية. يستخدم MLVA تعدد الأشكال لتسلسلات الحمض النووي المتكررة جنبًا إلى جنب لتوصيف الأنواع الميكروبية ، بينما يستخدم MLST تعدد الأشكال لتسلسل الحمض النووي للأجزاء الداخلية من جينات التدبير المنزلي المتعددة لتوصيف الأنواع الميكروبية.إذن ، هذا هو الفرق الرئيسي بين MLVA و MLST.
