shRNA مقابل siRNA
أثناء عملية تداخل الحمض النووي الريبي (RNAi) ، يتم التخلص من التعبير عن الجين المستهدف بخصوصية وانتقائية عالية. RNAi هي عملية طبيعية ، وتنطوي على تدخل صغير من الحمض النووي الريبي (سيرنا) و RNA قصير الشعر (shRNA) و shRNA ثنائي الوظيفة. في الوقت الحاضر ، يستخدم RNAi على نطاق واسع كأداة لعلاج السرطان الشخصي. يتم تنفيذ تطبيقات RNAi بشكل أساسي باستخدام جزيئات siRNA مزدوجة الشريطة المركبة كيميائيًا وجزيئات shRNA القائمة على ناقلات. على الرغم من أن هذين الجزيئين لهما نتائج وظيفية متشابهة ، إلا أنهما يختلفان في بنيتهما ؛ وبالتالي ، تختلف أيضًا الآليات الجزيئية للعمل ومسارات الحمض النووي الريبي والتأثيرات غير المستهدفة لهذين الجزيئين.
shRNA
shRNA عبارة عن سلسلة من جزيئات RNA الصغيرة التي تجعل منعطفًا ضيقًا يمكن استخدامه لإسكات التعبير الجيني المستهدف أثناء RNAi. يتم التعبير عن shRNA بواسطة ناقل ، والذي يمكن أن يكون إما فيروساً أو بكتيريا أو عن طريق توصيل البلازميدات. يتم تصنيعها في نواة الخلايا ونقلها إلى السيتوبلازم لمزيد من العمليات. هذه الجزيئات لها مسارات نضج متشابهة لميرنا. وبالتالي ، فإن تخليق ميرنا قد وفر الأساس لفهم تخليق shRNA. يمكن لأي من RNA polymerase II أو III نسخ shRNA من خلال مروج RNA polymerase II أو III. تتمثل ميزة استخدام shRNAs في أنها تتمتع بمعدل منخفض نسبيًا من التدهور والدوران. العيب هو أنه يحتاج إلى ناقل تعبير ، مما قد يتسبب في بعض مشكلات السلامة.
siRNA
siRNAs عبارة عن جزيئات RNA مزدوجة مجدولة تتكون من 20-25 زوجًا قاعديًا في الطول. تستخدم هذه لقمع الجينات عن طريق إسكات أي جين مع تسلسل النوكليوتيدات التكميلية في مسار RNAi.ضربة قاضية للجينات عن طريق تعداء siRNA غالبًا ما تكون غير ناجحة بسبب التأثير العابر ؛ خاصة في الخلايا سريعة الانقسام ولا يستمر الكبت لفترة أطول. للتغلب على هذه المشكلة ، يتم تعديل siRNA عن طريق إدخال بنية دبوس شعر قصيرة. يُعرف هذا الجزيء المعدل بعد ذلك باسم shRNA. يجب تحويل shRNA إلى siRNA بواسطة Dicer من أجل متابعة وظيفتها الطبيعية.
ما الفرق بين shRNA و siRNA؟
• على عكس siRNA ، تتمتع shRNA بهيكل دبوس شعر إضافي. shRNA هو نسخة معدلة من siRNA.
• تتطلب shRNA متجه تعبير ، بينما لا تتطلب siRNA.
• يمكن استخدام shRNA لضربة قاضية طويلة المدى بينما يمكن استخدام siRNA فقط لضربة قاضية قصيرة المدى للجينات.
• على عكس تثبيط الجينات لـ siRNA ، فإن كبت shRNA يدوم طويلاً ، وإذا تم إدخاله عبر ناقل فيروسي مناسب ، فقد ينتج عنه تأثيرات إسكات الجينات الدائمة.
• مطلوب Dicer لتحويل shRNA مرة أخرى إلى جزيء siRNA من أجل تنفيذ وظائفه الطبيعية.
