الفرق الرئيسي - Alpha Helix vs Beta Pleated Sheet
حلزون ألفا والصفائح المطوية بيتا هما أكثر الهياكل الثانوية شيوعًا في سلسلة بولي ببتيد. هذان المكونان الهيكليان هما أول الخطوات الرئيسية في عملية طي سلسلة البولي ببتيد. يكمن الاختلاف الرئيسي بين Alpha Helix و Beta Pleated Sheet في هيكلها ؛ لديهم شكلين مختلفين للقيام بعمل معين.
ما هو Alpha Helix؟
حلزون ألفا هو ملف أيمن من بقايا الأحماض الأمينية على سلسلة بولي ببتيد. يمكن أن يختلف مدى بقايا الأحماض الأمينية من 4 إلى 40 من المخلفات.تساعد الروابط الهيدروجينية المتكونة بين أكسجين مجموعة C=O على الملف العلوي وهيدروجين مجموعة NH للملف السفلي على تثبيت الملف معًا. يتم تكوين رابطة هيدروجينية لكل أربعة بقايا من الأحماض الأمينية في السلسلة بالطريقة المذكورة أعلاه. يمنحه هذا النمط الموحد ميزات محددة مثل سمك الملف ويحدد طول كل منعطف كامل على طول محور اللولب. يعتمد استقرار بنية ألفا الحلزونية على عدة عوامل.
ذرات O باللون الأحمر ، ذرات N باللون الأزرق ، والروابط الهيدروجينية كخطوط منقطة خضراء
ما هي الورقة المطوية بيتا؟
ورقة مطوية بيتا ، والمعروفة أيضًا باسم ورقة بيتا ، تعتبر الشكل الثاني للبنية الثانوية في البروتينات. يحتوي على خيوط بيتا متصلة بشكل جانبي بواسطة ما لا يقل عن اثنين أو ثلاثة روابط هيدروجينية أساسية لتشكيل ورقة ملتوية ومثنية كما هو موضح في الصورة.حبلا بيتا هو امتداد لسلسلة بولي ببتيد ؛ طوله بشكل عام يساوي 3 إلى 10 أحماض أمينية ، بما في ذلك العمود الفقري في تأكيد ممتد.
4-تقطعت بهم السبل - جزء من ورقة مضادة للتوازي من بنية بلورية من إنزيم الكاتلاز.
أ) إظهار الروابط الهيدروجينية المضادة (المنقطة) بين مجموعات الببتيد NH و CO على السلاسل المجاورة. تشير الأسهم إلى اتجاه السلسلة ، وتحدد ملامح كثافة الإلكترون الذرات غير H. ذرات O هي كرات حمراء ، N ذرات زرقاء ، وذرات H تم حذفها من أجل التبسيط ؛ تظهر السلسلة الجانبية فقط إلى السلسلة الجانبية الأولى C atom (باللون الأخضر)
ب) عرض الحافة للخيطين المركزيين
في الأوراق المطوية بيتا ، تعمل سلاسل البولي ببتيد جنبًا إلى جنب.تحصل على اسم "الورقة المطوية" بسبب المظهر المتموج للهيكل. ترتبط ببعضها البعض بواسطة روابط هيدروجينية. تسمح هذه البنية بتكوين المزيد من روابط الهيدروجين عن طريق تمديد سلسلة البولي ببتيد.
ما هو الفرق بين Alpha Helix و Beta Pleated Sheet؟
هيكل Alpha Helix و Beta Pleated Sheet
Alpha Helix:
في هذا الهيكل ، يرتبط العمود الفقري متعدد الببتيد بإحكام حول محور وهمي كهيكل حلزوني. يُعرف أيضًا باسم الترتيب الحلزوني لسلسلة الببتيد.
يحدث تكوين بنية ألفا الحلزونية عندما تكون سلاسل البولي ببتيد ملتوية في دوامة. يتيح ذلك لجميع الأحماض الأمينية في السلسلة تكوين روابط هيدروجينية (رابطة بين جزيء الأكسجين وجزيء الهيدروجين) مع بعضها البعض. تسمح روابط الهيدروجين للحلزون بالاحتفاظ بالشكل اللولبي وإعطاء ملف ضيق. هذا الشكل اللولبي يجعل حلزون ألفا قويًا جدًا.
يشار إلى الروابط الهيدروجينية بالنقاط الصفراء.
ورقة مطوية بيتا:
عندما تتداخل شظيتان أو أكثر من سلسلة (سلاسل) البولي ببتيد مع بعضها البعض ، مما يشكل صفًا من الروابط الهيدروجينية مع بعضها البعض ، يمكن العثور على الهياكل التالية. يمكن أن يحدث بطريقتين ؛ الترتيب المتوازي والترتيب المضاد.
أمثلة على الهيكل:
Alpha Helix: يمكن أخذ أظافر الأصابع أو أظافر القدم كمثال على بنية حلزون ألفا.
ورقة مطوية بيتا: هيكل الريش مشابه لهيكل الصفيحة المطوية بيتا.
ملامح الهيكل:
Alpha Helix: في بنية alpha helix ، يوجد 3.6 من الأحماض الأمينية في كل دورة من اللولب.جميع روابط الببتيد عبارة عن روابط مستوية ومستوية ، وتشير مجموعات N-H في روابط الببتيد في نفس الاتجاه ، وهو موازٍ تقريبًا لمحور اللولب. تشير مجموعات C=O لجميع روابط الببتيد في الاتجاه المعاكس ، وهي موازية لمحور اللولب. ترتبط مجموعة C=O لكل رابطة ببتيدية بمجموعة N-H لرابطة الببتيد لتشكيل رابطة هيدروجينية. يتم توجيه جميع مجموعات R- للخارج من اللولب.
ورقة مطوية بيتا: كل رابطة ببتيدية في الورقة المطوية بيتا مستوية ولها شكل عابر. توجد مجموعات C=O و N-H من روابط الببتيد من السلاسل المجاورة في نفس المستوى وتشير إلى بعضها البعض لتشكيل رابطة هيدروجينية بينهما. يمكن أن تحدث جميع مجموعات R في أي سلسلة بدلاً من ذلك أعلى وأسفل مستوى الورقة.
تعريفات:
الهيكل الثانوي: هو شكل بروتين قابل للطي بسبب الرابطة الهيدروجينية بين عموده الفقري أميد ومجموعات الكربونيل.
