الفرق الرئيسي - المنقولات البكتيرية مقابل التكامل الفيروسي
تطورت المادة الوراثية القابلة للنقل من خلال استراتيجيتين رئيسيتين للانتقال من منطقة إلى المنطقة التالية داخل الجينوم وفيما بينها. تتمثل إحدى الطرق في الإزاحة من خلال جزيء RNA قبل تكوين جزيء DNA بينما يتضمن المسار الآخر وسائط DNA. تعتبر Transposases والتكامل الفيروسي أمثلة على هذه المواد الوراثية القابلة للنقل. ترتبط الترانسبوزسات البكتيرية بنهاية الينقولات وتسهل تحفيز حركة الينقولات إلى جزء آخر من الجينوم من خلال آليات مختلفة.تكامل الفيروسات القهقرية هي إنزيمات تساعد في دمج المادة الجينية للفيروس القهقري مثل فيروس نقص المناعة البشرية في المادة الوراثية (DNA) للخلية المضيفة التي يصيبها. هذا هو الفرق الرئيسي بين transposases البكتيرية و التكامل الفيروسي.
ما هي المنقولات البكتيرية؟
يمكن تعريف Transposase على أنه إنزيم مرتبط بنهاية الينقولات التي تسهل تحفيز حركة الينقولات إلى جزء آخر من الجينوم من خلال آليات مختلفة. وتشمل هذه الآليات "آلية القص واللصق" و "آلية التحويل المتماثل". تم إدخال Transposase لأول مرة من خلال استنساخ الإنزيم المطلوب لتحويل Tn3 transposon. تم استخدام استراتيجيتين مهمتين بواسطة العناصر الجينية القابلة للنقل من أجل الإزاحة بين الجينومات أو من موقع إلى آخر. يعتبر النقل عبر وسيط من الحمض النووي الريبي قبل تخليق نسخة من الحمض النووي إحدى الإستراتيجيات بينما ترتبط الأخرى بوسائط الحمض النووي وحدها.تحدث تفاعلات إعادة التركيب التي تشارك في تكامل كلا العنصرين بسبب إنزيمات خاصة بالعنصر. وهكذا ، في حالة عناصر الحمض النووي ، تُعرف هذه الإنزيمات باسم الترانسبوزاس بينما في حالة عناصر الحمض النووي الريبي ، تُعرف باسم الجمل المتكاملة.
عند مقارنة الاختلافات بين استراتيجيتي التحويل ، يبدو أن عملية الإدراج متطابقة كيميائيًا. ولكن ، تشير الأدلة الحديثة إلى أن بعض أوجه التشابه في آلية التكامل تظهر في مناطق تسلسل الأحماض الأمينية التي تشكل موقعًا نشطًا ؛ عزر DDE. يتم تصنيف خمس عائلات من transposases في الوقت الحالي ، ولكن عدد العائلات لم يزداد بعد مع أحرف ترانسبوزيز جديدة. تشمل العائلات DDE ترانسبوزيز ، ترانسبوزيز التيروزين (Y) ، ترانسبوزيز سيرين (S) ، ترانسبوزيز الدائرة المتداول ، النسخ العكسية / نوكليازات داخلية (RT / En) إلخ. تستخدم هذه العائلات آليات تحفيزية فريدة لكسر وإعادة الانضمام للحمض النووي.يتضمن DDE transposase آلية القص واللصق الخاصة باللينقول الأصلي ويحمل ثلاث مجموعات من الأحماض الأمينية المحفوظة وهي ؛ الأسبارتات (D) والأسبارتات (D) والغلوتامات (E). تتضمن أيضًا ترانسبوزسات التيروزين آلية القص واللصق من خلال الاستفادة من بقايا التيروزين ، والتي تكون خاصة بالموقع.
الشكل 01: منقولات بكتيرية
تتضمن ترانسبوزسات السيرين وسيطًا من الحمض النووي الدائري وتنفذ آلية القص واللصق تمامًا كما هو الحال في العائلات المذكورة أعلاه. تشارك ترانسبوزيز الدائرة المتدحرجة في آلية النسخ حيث يتم نسخ خيط واحد مباشرة إلى الموقع المستهدف من خلال تكرار الحمض النووي. هذا يضمن أن حبلا القالب والشريط المنسوخ لهما حبلا تم تصنيعه حديثًا.إن ترانسبوزيز النسخ العكسي / نوكليازات داخلية لها آليات مختلفة للتبديل.
ما هي تكاملات الفيروسات القهقرية؟
في سياق Retroviral Integrase ، يُعتبر إنزيمًا فيروسيًا رجعيًا يساعد في دمج المادة الوراثية للفيروس القهقري مثل فيروس نقص المناعة البشرية في المادة الوراثية (DNA) للخلية المصابة. غالبًا ما يتم الخلط بين هذه الجمل المتكاملة للفيروسات القهقرية وجمل العاثيات. أمثلة على العبارات المتكاملة للعاثية هي λ تكامل فجائي. لكن هذه إنزيمات مختلفة تمامًا ولا ينبغي الخلط بينها. فيما يتعلق بتشكيل مركب ما قبل التكامل الفيروسي ، يلعب الإنزيم الفيروسي الارتجاعي دورًا رئيسيًا. تتكون بروتينات انتجراز الفيروسات القهقرية عادة من ثلاثة (03) مجالات أساسية. هذه المجالات متصلة بواسطة روابط مرنة.
تشمل المجالات الثلاثة مجال ربط الزنك الطرفي N حيث يتم توصيل ثلاث حزم حلزونية واستقرارها من خلال التنسيق بمشاركة Zn2 +كاتيون ، طية RNase H المجال الأساسي التحفيزي ومجال ربط الحمض النووي الطرفي C ، وهو أضعاف SH3.من خلال الاستقصاء ومن خلال المعلومات البيوكيميائية والهيكلية ، فإنه يشير إلى أن Integrase الفيروسية القهقرية لديها القدرة على العمل كمخفتات باهتة (tetramer). في سياق multimerisation وربط الحمض النووي الفيروسي ، جميع المجالات الثلاثة لبروتين انتيجريز الفيروسي. تتمثل الوظيفة الرئيسية للإنزيم الفيروسي الارتجاعي في إدخال مادته الجينية في الحمض النووي المضيف. هذه الخطوة هي الخطوة الأكثر أهمية في التكاثر الفيروسي لفيروس نقص المناعة البشرية. بمجرد دمجها بنجاح ، ستكون موجودة في الحمض النووي الصبغي للخلية لبقية عمرها.
الشكل 02: تكامل الفيروسات القهقرية
لذلك ، بمجرد التكامل لا يعود للخلية. تتضمن هذه الجمل المدمجة في الفيروسات القهقرية تحفيز تفاعلين رئيسيين بما في ذلك معالجة نهائية 3 'والربط التساهمي.خلال 3 'معالجة نهائية ، تتم إزالة 2-3 نيوكليوتيدات من طرفي الحمض النووي الفيروسي الثلاثة بهدف الكشف عن CA ثنائي النوكليوتيدات للنهايات الثلاثة للحمض النووي الفيروسي ، وأثناء الربط التساهمي ، تتم معالجة الأطراف الثلاثة من يتم ربط الحمض النووي الفيروسي تساهميًا في الحمض النووي الصبغي المضيف.
ما هو التشابه بين Transposases البكتيرية والتكامل Retroviral؟
تحتوي كل من Transposases البكتيري والتكامل الفيروسي على تسلسلات متشابهة من الأحماض الأمينية
ما هو الفرق بين الناقلات البكتيرية والتكامل الفيروسي؟
المنقولات البكتيرية مقابل التكامل الفيروسي |
|
| Bacterial Transposase هو إنزيم مرتبط بنهاية الينقولات أثناء تسهيل تحفيز حركة الينقولات إلى جزء آخر من الجينوم من خلال آليات مختلفة. | تكامل الفيروسات القهقرية يعتبر إنزيم فيروسات قهقرية يساعد في دمج المادة الوراثية للفيروس القهقري مثل فيروس نقص المناعة البشرية في المادة الوراثية (DNA) للخلية المصابة. |
| مناطق الربط | |
| مناطق ربط محددة للغاية مطلوبة لعمليات النقل البكتيرية. | مطلوب تسلسل نيوكليوتيد أقل أو معدوم للربط. |
ملخص - Transposases البكتيرية مقابل تكامل الفيروسات القهقرية
تعتبر الترانسبوزسات البكتيرية إنزيم فيروسات قهقرية يساعد في دمج المادة الوراثية للفيروس القهقري مثل فيروس نقص المناعة البشرية في المادة الوراثية (DNA) للخلية المصابة. تم استخدام استراتيجيتين مهمتين بواسطة العناصر الجينية القابلة للنقل من أجل الإزاحة بين الجينومات أو من موقع إلى آخر.يتم تصنيف خمس عائلات من transposases في الوقت الحالي ، ولكن عدد العائلات لم يزداد بعد مع أحرف ترانسبوزيز جديدة. Retroviral Integrase ، يعتبر إنزيمًا للفيروسات القهقرية يساعد في دمج المادة الوراثية للفيروس القهقري مثل فيروس نقص المناعة البشرية في المادة الوراثية (DNA) للخلية المصابة. تتكون بروتينات انتجراز الفيروسات القهقرية عادة من ثلاثة (03) مجالات أساسية. تتمثل الوظيفة الرئيسية للإنزيم الفيروسي الارتجاعي في إدخال مادته الجينية في الحمض النووي المضيف. هذه الخطوة هي الخطوة الأكثر أهمية في التكاثر الفيروسي لفيروس نقص المناعة البشرية. لذلك ، بمجرد الدمج ، لن يكون هناك عائد للخلية. هذا هو الفرق بين الناقلات البكتيرية و Retroviral Integrase.
قم بتنزيل ملف PDF الخاص بـ Bacterial Transposases مقابل تكامل Retroviral
يمكنك تنزيل نسخة PDF من هذه المقالة واستخدامها لأغراض غير متصلة بالإنترنت وفقًا لملاحظة الاقتباس. يرجى تنزيل نسخة PDF من هنا: الفرق بين Transposases البكتيرية والتكامل الفيروسي
