الفرق بين CDS و ORF

2024 مؤلف: Alex Aldridge | [email protected]. آخر تعديل: 2023-12-17 13:32

الاختلاف الرئيسي بين CDS و ORF هو أن CDS هو أن تسلسل النوكليوتيدات الفعلي للجين الذي يترجم إلى بروتين بينما ORF هو امتداد لتسلسل الحمض النووي الذي يبدأ بموقع بدء الترجمة (رمز البدء) وينتهي بـ موقع إنهاء الترجمة (stop codon).

الجين لديه تسلسل ترميز (CDS). وهو يتألف من مجموع exons للجين وكودون بدء وكودون توقف. إنه الجزء الفعلي من الجين الذي يترجم وينتج البروتين. إطار القراءة المفتوح أو ORF هو تسلسل نيوكليوتيد يقع بين كودون البداية وكودون التوقف. لا يوجد كودون توقف داخل ORF يقطع الكود الجيني الذي يترجم إلى بروتين.في بدائيات النوى ، CDS و ORF للجين هو نفسه

ما هو CDS؟

CDS أو تسلسل الترميز هو جزء من الجين الذي يترجم في الواقع إلى بروتين. وهو يتألف من exons واثنين من الكودونات المعروفة باسم كودون AUG وكودون الإيقاف. لا تحتوي CDS على منطقتين غير مترجمتين: 5 'UTR و 3' UTR. علاوة على ذلك ، لا يتم تضمين الإنترونات في CDS.

الشكل 01: تسلسل الترميز

عند مقارنتها مع الجينوم الكامل للفرد ، فإن تسلسلات الترميز هي جزء صغير. يتكون تسلسل الترميز من تسلسل النوكليوتيدات الضروري لعمل تسلسل الأحماض الأمينية للبروتين. لذلك ، CDS هي اكسونات مركزة يمكن تقسيمها إلى ثلاثة توائم نيوكليوتيدات أو أكواد. الكودونات تؤدي إلى نشوء أحماض أمينية.

ما هو ORF؟

إطار القراءة المفتوح أو ORF هو الامتداد المستمر لتسلسل النيوكليوتيدات الذي يبدأ بكودون البداية وينتهي برمز التوقف.بكلمات بسيطة ، يشير ORF إلى منطقة تسلسل النوكليوتيدات الواقعة بين كودونات البداية والتوقف. في ما بين ذلك ، لا يوجد رمز توقف يقطع ORF. تسلسل النوكليوتيدات بين بدء وإيقاف ترميز كودون للأحماض الأمينية. بشكل عام ، رمز البدء هو ATG بينما رموز الإيقاف هي TAG و TAA و TGA. يعطي ORF بروتينًا وظيفيًا عند نسخه وترجمته. ومن ثم ، يشتمل ORF على كودون البدء والعديد من الكودونات في المنطقة الوسطى وكودون التوقف. ومن المثير للاهتمام أن ORF له طول يمكن تقسيمه على ثلاثة.

الشكل 02: فتح إطار القراءة

في بدائيات النوى ، نظرًا لعدم وجود إنترونات ، فإن ORF هو تسلسل ترميز الجين الذي ينتقل مباشرة إلى mRNA. لذلك ، CDS و PRF هي نفسها في بدائيات النوى. عند البحث عن الجينات في بدائيات النوى ، من السهل اكتشاف ORF والعثور على جين في بدائيات النوى.في حقيقيات النوى ، نظرًا لوجود إنترونات ، فإن ORF هو تسلسل الكودون الذي يتشكل بعد المعالجة أو تضفير الحمض النووي الريبي. ORF هو جزء من الدليل الذي يساعد على التنبؤ الجيني طالما من المحتمل أن يكون ORF جزءًا من الجين.

ما هي أوجه التشابه بين CDS و ORF؟

• في بدائيات النوى ، CDS و ORF هي نفسها.
• كلاهما لهما بدء الكود وإيقاف الكود.
• لديهم عدد من النيوكليوتيدات التي يمكن تقسيمها على ثلاثة.
• بمجرد الترجمة ينتجون متواليات من الأحماض الأمينية.

ما هو الفرق بين CDS و ORF؟

CDS هو الجزء الفعلي من الجين الذي يترجم إلى بروتين بينما ORF هو امتداد الحمض النووي بين كودون البداية وكودون التوقف. إذن ، هذا هو الفرق الرئيسي بين CDS و ORF. علاوة على ذلك ، لا تحتوي CDS على إنترونات ، لكن ORF قد تحتوي على إنترونات. يتم نسخ CDS بالكامل إلى تسلسل mRNA كامل بينما يمكن أن يكون ORF جزءًا من تسلسل mRNA.وبالتالي ، هذا فرق آخر بين CDS و ORF.

أدناه جدول رسوم بيانية جنبًا إلى جنب الاختلافات بين CDS و ORF.

ملخص - CDS مقابل ORF

CDS و ORF جزءان مهمان من الجين. يشير CDS إلى المنطقة الفعلية للحمض النووي التي تترجم إلى بروتين. ORF هو تسلسل DNA يبدأ بكودون البداية "ATG" وينتهي بأي من أكواد الإنهاء الثلاثة (TAA أو TAG أو TGA). قد يكون ORF جزءًا من الرنا المرسال الكامل للجين. ومع ذلك ، فإن تسلسل تشفير الجين ينسخ لإكمال تسلسل الرنا المرسال. جميع أقراص CDS هي ORFs. ولكن ليست كل ORFs هي CDS. وبالتالي ، هذا يلخص الفرق بين CDS و ORF.