الاختلاف الرئيسي بين NGS و WGS هو أن تسلسل الجيل التالي (NGS) عبارة عن تقنية تسلسل متوازية بشكل كبير من الجيل الثاني تتميز بإنتاجية عالية وتكلفة منخفضة وسريعة ، في حين أن تسلسل الجينوم الكامل (WGS) هو طريقة شاملة لتحليل الحمض النووي الجيني للخلية بالكامل في وقت واحد باستخدام تقنيات التسلسل مثل تسلسل Sanger أو نهج البندقية أو تسلسل NGS عالي الإنتاجية.
في العقود القليلة الماضية ، زاد فهم جينوم البشر والحيوانات الأخرى بشكل كبير بسبب اكتشاف تقنيات التسلسل السريع وأدوات المعلوماتية الحيوية. تقنيات التسلسل التقليدية مثل تسلسل Sanger لها حدودها ، مما دعا إلى تطوير طرق جديدة للتسلسل السريع مثل تسلسل الجيل التالي (NGS) وتسلسل النانو.تقنية تسلسل الجينوم الكامل (WGS) هي طريقة حديثة مستخدمة بالفعل في العديد من مشاريع البحث الجينومي ، مثل 100000 مشروع جينومي من قبل Genomic England ، المملكة المتحدة. لذلك ، NGS و WGS هما طريقتان للتسلسل يتم دمجهما حاليًا في العديد من المشاريع الجينية.
ما هو NGS؟
NGS (تسلسل الجيل التالي) هي تقنية تسلسل متوازية بشكل كبير من الجيل الثاني تتميز بإنتاجية عالية وتكلفة منخفضة وسريعة. لا يوجد تعريف دقيق لتسلسل الجيل التالي. لكن يمكننا تمييزه بوضوح عن تقنيات التسلسل التقليدية القائمة على الشعيرات الدموية. يسمح تسلسل الجيل التالي بتسلسل جزيء DNA بحجم إجمالي أكبر من مليون زوج قاعدي في تجربة واحدة. إنه يوفر سرعة غير مسبوقة وخيارات إنتاجية عالية ، مثل السماح بتسلسل الحمض النووي لأفراد متعددين في نفس الوقت. يتم تحقيق ذلك عن طريق تصغير حجم تفاعلات التسلسل الفردية. علاوة على ذلك ، يحد هذا أيضًا من حجم الأدوات ويقلل من تكلفة الكواشف لكل تفاعل.
الشكل 01: منصات NGS
NGS هي طريقة تسلسل قصيرة القراءة أحدثت بالفعل ثورة في مجال البحث البيولوجي. علاوة على ذلك ، يتم تطبيق NGS في مجالات مختلفة مثل تسلسل الجينوم de novo ، وتسلسل الجينوم الكامل ، وتحليل النسخ ، وتسلسل الحمض النووي الريبي الصغير والحمض النووي الريبي الصغير ، وإعادة التسلسل المستهدف ، وتسلسل الإكسوم الكامل.
ما هو WGS؟
WGS (تسلسل الجينوم الكامل) هي طريقة شاملة لتحليل الحمض النووي الجيني بأكمله للخلية في وقت واحد باستخدام تقنيات التسلسل مثل تسلسل Sanger أو نهج البندقية أو تسلسل NGS عالي الإنتاجية. يُعرف أيضًا باسم تسلسل الجينوم الكامل أو تسلسل الجينوم الكامل. يستلزم تسلسل الجينوم الكامل تسلسل كل الحمض النووي الصبغي للكائن الحي وكذلك الحمض النووي في الميتوكوندريا ، وللنباتات ، الحمض النووي في البلاستيدات الخضراء في وقت واحد.تمكن WGS العلماء من قراءة التسلسل الدقيق لجميع الحروف التي تشكل المجموعة الكاملة من الحمض النووي. من المتوقع أن تحدث WGS باستخدام منصة NGS ثورة في الإعداد السريري.
الشكل 02: التسلسل الهرمي للبندقية WGS مقابل التسلسل الهرمي
تم إدخال تسلسل الجينوم الكامل إلى الرعاية السريرية في عام 2014. علاوة على ذلك ، يتضمن تطبيق WGS التسلسل الجيني على مستوى SNP لتحديد المتغيرات الوظيفية في دراسات الارتباط ، والتدخل العلاجي في الطب الشخصي ، وعلم الأحياء التطوري ، والتحليل الجيني المقارن ، ودراسات الطفرات وإعادة الترتيب ، ودراسات ارتباط المتغيرات النادرة ، والتنبؤ بقابلية المرض والاستجابة للأدوية.
ما هي أوجه التشابه بين NGS و WGS؟
- NGS و WGS نوعان من تقنيات التسلسل.
- كلا التقنيتين إما تسلسل الحمض النووي أو الحمض النووي الريبي.
- هذه التقنيات جديدة وموثوقة.
- كلاهما يستخدم في تشخيص الأمراض واكتشاف الأدوية.
ما هو الفرق بين NGS و WGS؟
NGS هي تقنية تسلسل متوازية بشكل كبير من الجيل الثاني تتميز بإنتاجية عالية وتكلفة منخفضة وسريعة ، بينما WGS هي طريقة شاملة لتحليل الحمض النووي الجيني للخلية بالكامل في وقت واحد باستخدام تقنيات التسلسل مثل كتسلسل سانجر أو نهج البندقية أو تسلسل NGS عالي الإنتاجية. إذن ، هذا هو الفرق الرئيسي بين NGS و WGS. علاوة على ذلك ، تتكون NGS من أساليب التسلسل من الجيل الثاني فقط بينما تتكون WGS من أساليب تسلسل الأجيال الأولى والثانية والثالثة.
يعرض الجدول التالي الاختلافات بين NGS و WGS في شكل جدول للمقارنة جنبًا إلى جنب.
ملخص - NGS مقابل WGS
في العقود الماضية ، تم تطبيق تقنيات التسلسل المختلفة بشكل روتيني في الأبحاث الجزيئية المعاصرة. وحتى أنها أدوات قوية جدًا للعديد من التطبيقات السريرية. NGS و WGS هما طريقتان للتسلسل يتم دمجهما حاليًا في العديد من المشاريع الجينية. NGS هي تقنية تسلسل من الجيل الثاني تتميز بإنتاجية عالية وتكلفة منخفضة وسريعة. من ناحية أخرى ، تعد WGS طريقة لتحليل الحمض النووي الجيني بأكمله أو الحمض النووي الجيني الكامل للخلية في وقت واحد باستخدام تقنيات التسلسل مثل تسلسل Sanger أو نهج البندقية أو تسلسل NGS عالي الإنتاجية. إذن ، هذا هو ملخص الفرق بين NGS و WGS.
