الفرق بين [كدنا] والمكتبة الجينومية

2024 مؤلف: Alex Aldridge | [email protected]. آخر تعديل: 2023-12-17 13:32

الفرق الرئيسي - [كدنا] مقابل مكتبة الجينوم

هناك نوعان رئيسيان من مكتبات الحمض النووي التي أنشأها العلماء باستخدام تقنيات الهندسة الوراثية. تلك هي مكتبة (كدنا) ومكتبة الجينوم. يتمثل الاختلاف الرئيسي بين cDNA ومكتبة الجينوم في أن مكتبة cDNA تحتوي على الحمض النووي التكميلي المستنسخ لمجموع الرنا المرسال للكائن الحي بينما تحتوي مكتبة الحمض النووي الجينومي على الأجزاء المستنسخة من الجينوم الكامل للكائن الحي. مكتبة الحمض النووي الجينومي أكبر من مكتبة cDNA.

ما هي مكتبة الجينوم؟

مكتبة الحمض النووي الجينومي عبارة عن مجموعة من الحيوانات المستنسخة التي تحمل أجزاء من الحمض النووي الجينومي الكلي للكائن الحي.يحتوي على الحمض النووي الجينومي الكامل لهذا الكائن الحي ، بما في ذلك التسلسلات المشفرة وغير المشفرة. يتم إنشاء مكتبة الجينوم بواسطة تقنية الحمض النووي المؤتلف متبوعًا بالاستنساخ (الهندسة الوراثية). هناك خطوات مختلفة متضمنة في البناء كما هو موضح في الشكل 01. تبدأ العملية بعزل الحمض النووي الجيني. باستخدام بروتوكول مناسب لاستخراج الحمض النووي ، يجب عزل الحمض النووي الجيني الكلي للكائن الحي. ثم يجب تحويل الحمض النووي إلى أحجام يمكن التحكم فيها أو إلى أجزاء محددة عن طريق تقييد نوكلياز (إنزيمات قطع الحمض النووي). يجب إدخال الحمض النووي المجزأ في النواقل باستخدام روابط DNA (إنزيمات الانضمام إلى الحمض النووي). المتجه هو كائن حي ذاتي التكاثر. تستخدم البلازميدات والعاثيات بشكل شائع في تكنولوجيا الحمض النووي المؤتلف. تُعرف هذه النواقل المرتبطة بجزيئات الحمض النووي المؤتلف لأنها تحمل كلاً من تسلسل الحمض النووي الخاص والمدخل. تضاف النواقل المؤتلفة إلى البكتيريا المضيفة وتصنع لامتصاص النواقل المؤتلفة داخل الخلية البكتيرية.يجب أن تنمو البكتيريا ذات النواقل المؤتلفة (البلازميدات) في وسط استزراع. أثناء التكاثر البكتيري ، يقوم الحمض النووي البكتيري ، جنبًا إلى جنب مع البلازميدات المؤتلفة ، بتكرار الجينوم الخاص بها وإنتاج الحيوانات المستنسخة. تحتوي هذه الحيوانات المستنسخة على الجينوم الكامل للكائن المصدر. ومن ثم يطلق عليها مكتبة الجينوم. يمكن بسهولة فصل البلازميدات عن الحمض النووي الصبغي البكتيري لبناء المكتبة الجينومية لهذا الكائن الحي. إذا كان كائن حي معين يحتوي على جينات مهتمة ، فمن السهل اكتشافه في مكتبة الجينوم عن طريق التهجين باستخدام مجسات جزيئية (علامات).

مكتبات الجينوم مهمة لدراسة التركيب الجيني والوظيفة والجينات المحددة وموقع الجين ورسم خرائط الجينات والطفرات وتسلسل الجينات وتحديد الجينات العلاجية الجديدة وما إلى ذلك.

Figure_1: إنشاء مكتبة الجينوم

ما هي مكتبة cDNA؟

مكتبة cDNA عبارة عن مجموعة من استنساخ الحمض النووي (cDNA) التكميلي المركب من إجمالي مرنا للكائن الحي. يتضمن إجراء البناء خطوات مختلفة. تنقية إجمالي الرنا المرسال من كائن حي هو الخطوة الأولى. يتم تحويل الرنا المرسال المعزول إلى خيوط (كدنا) من خلال عملية تسمى النسخ العكسي. يتم تسهيل النسخ العكسي بواسطة إنزيم يسمى النسخ العكسي. إنه يستخدم برايمر صغير 3 'ويبدأ في تركيب أول حبلا cDNA مكمل لقالب mRNA. يتم تحويل الناتج cDNA المزدوج الذي تقطعت به السبل إلى شظايا أصغر باستخدام نوكليازات تقييدية وإدراجها في نواقل مناسبة. ثم تضاف هذه الجزيئات المؤتلفة المركبة إلى كائن حي مضيف وتنمو في وسط استنساخ لإنتاج الحيوانات المستنسخة. تُعرف مجموعة الحيوانات المستنسخة التي تحتوي على أجزاء (كدنا) من كائن حي بمكتبة (كدنا). لا تحتوي شرائح الرنا المرسال الناضجة المقطعة بالكامل على إنترونات ومناطق تنظيمية.لذلك الأجزاء غير المشفرة غير موجودة في مكتبات (كدنا) على عكس مكتبة الجينوم.

مكتبات[كدنا] مهمة لتحليل مناطق الترميز ، وظائف الجينات ، التعبير عن الجينات إلخ.

Figure_2: إنشاء مكتبة cDNA

ما هو الفرق بين [كدنا] والمكتبة الجينومية؟

cDNA مقابل مكتبة الجينوم
مكتبةcDNA عبارة عن مجموعة من الحيوانات المستنسخة التي تحمل الحمض النووي التكميلي لـ mRNA للكائن الحي	مكتبة الجينوم عبارة عن مجموعة من الحيوانات المستنسخة التي تحمل إجمالي الحمض النووي الجيني للكائن الحي.
الترميز مقابل التسلسلات غير المشفرة
تحتوي مكتبةcDNA على تسلسلات الترميز فقط ؛ لا تحتوي على إنترونات.	تتكون مكتبة الجينوم من الحمض النووي الجيني بأكمله بما في ذلك الحمض النووي غير المشفر (الإنترونات والتنظيمية).
الحجم
مكتبة cDNA صغيرة.	مكتبة الجينوم كبيرة.
مادة البداية
مادة البداية هي mRNA	مادة البداية هي DNA.
مشاركة النسخ العكسي.
يحدث النسخ العكسي في أول توليف حبلا (كدنا).	لا يحدث النسخ العكسي.

ملخص - [كدنا] والمكتبة الجينومية

تمثل المكتبة الجينومية مجموعة من الحيوانات المستنسخة التي تحمل الحمض النووي الجيني الكلي المجزأ للكائن الحي. تمثل مكتبة (كدنا) مجموعة الحيوانات المستنسخة التي تحمل الحمض النووي التكميلي لمجموع مرنا الكائن الحي. يحتوي استنساخ (كدنا) على التسلسلات الموجودة في الرنا المرسال بينما يحتوي الاستنساخ الجينومي على تسلسل الجينوم بأكمله. هذا هو الفرق بين (كدنا) والمكتبة الجينومية.