الفرق الرئيسي بين الينقولات العكسية LTR و non-LTR هو أن الينقولات العكسية LTR هي نوع من الينقولات العكسية التي لها تكرارات طرفية طويلة في بنيتها ، في حين أن الينقولات العكسية غير LTR هي نوع من الينقولات العكسية التي لا تحتوي على تكرارات طرفية طويلة في هيكلهم.
الينقولات العكسية (العناصر القابلة للنقل من الفئة الأولى أو الينقولات عبر وسيطة RNA) هي نوع من المكونات الجينية التي يمكنها نسخ ولصق نفسها في مواقع جينومية مختلفة. يقومون بذلك عن طريق تحويل RNA مرة أخرى إلى DNA من خلال عملية تسمى النسخ العكسي باستخدام تبديل RNA وسيط.هناك نوعان رئيسيان من الينقولات العكسية مثل الينقولات العكسية LTR و non-LTR
ما هي الينقولات العكسية LTR؟
الينقولات العكسية LTR هي نوع من الينقولات العكسية التي لها تكرارات طرفية طويلة في بنيتها. يمكن العثور على خيوط طويلة من الحمض النووي المتكرر في كل طرف من نهايات الينقيع الخلفي LTR. تُعرف هذه باسم التكرارات الطرفية الطويلة (LTR). يبلغ طول كل LTR بضع مئات من الأزواج الأساسية. عادة ما يكون طول الينقولات العكسية LTR أكثر من 5 كيلو قاعدة. علاوة على ذلك ، بين التكرارات الطرفية الطويلة ، هناك جينات يمكن نسخها معادلة لجينات الفيروسات القهقرية gag و pol. تتداخل هذه الجينات بحيث تقوم بتشفير البروتياز الذي يعالج عادةً النسخة الناتجة إلى منتجات جينية وظيفية.
الشكل 01: الينقولات العكسية LTR
يصنع جين الكمامة من الينقولات العكسية منتجًا يرتبط بنسخ الينقولات العكسية الأخرى لتكوين جزيئات تشبه الفيروسات. يصنع جين Pol منتجات تحتوي على إنزيمات مثل نطاقات النسخ العكسي ، و Integrase ، و ribonuclease H. يقوم إنزيم النسخ العكسي بإجراء النسخ العكسي للحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين. إنزيم متكامل يدمج DNA retrotransposon في DNA الجينوم حقيقي النواة. نطاقات Ribonuclease H مفيدة في شق روابط phosphodiester بين وسيطة RNA. تقوم الينقولات العكسية LTR أيضًا بتشفير النصوص مع مواقع ربط الحمض النووي الريبي (tRNA) بحيث يمكن أن تخضع للنسخ العكسي بسهولة تامة. علاوة على ذلك ، نظرًا لأن الينقولات العكسية تحتوي على معلومات جينوم حقيقية النواة ، فيمكنها إدراج نسخ من نفسها في مواقع جينومية أخرى داخل خلية حقيقية النواة.
ما هي الينقولات العكسية غير LTR؟
الينقولات العكسية غير LTR هي نوع من الينقولات العكسية التي لا تحتوي على تكرارات نهائية طويلة في بنيتها.مثل الينقولات العكسية LTR ، تحتوي أيضًا الينقولات العكسية غير LTR على جينات للنسخة العكسية ، وبروتين ربط الحمض النووي الريبي ، والنوكلياز ، وأحيانًا نطاقات الريبونوكلياز H. لكنهم يفتقرون إلى التكرارات الطرفية الطويلة ؛ بدلاً من ذلك ، لديهم تكرار قصير يمكن أن يكون له ترتيب مقلوب من القواعد بجانب بعضها البعض. ترتبط بروتينات ربط الحمض النووي الريبي (RNA) بالوسيطة لنقل الحمض النووي الريبي ، وتكسر النيوكلياز روابط الفسفوديستر بين النيوكليوتيدات في الأحماض النووية.
الشكل 02: الينقولات العكسية LTR و Non-LTR
على الرغم من أنها الينقولات العكسية ، إلا أنها لا تستطيع إجراء النسخ العكسي باستخدام وسيط RNA بنفس طريقة الينقولات العكسية LTR. وذلك لأن الينقولات العكسية غير LTR لا تحتوي على تسلسلات تربط الحمض الريبي النووي النقال. ومن ثم ، فإن الينقولات العكسية غير LTR التي يتم نسخها إلى mRNA وترجمتها إلى بروتينات تعمل بمثابة نسخة عكسية.تقوم النسخة العكسية بعمل نسخة DNA من RNA غير LTR retrotransposon والذي يمكن دمجه في الجينوم في موقع جديد. علاوة على ذلك ، تنقسم الينقولات العكسية غير LTR إلى نوعين: LINEs (عناصر نووية متناثرة طويلة) و SINEs (عناصر نووية قصيرة تتخللها).
ما هي أوجه التشابه بين الينقولات العكسية LTR وغير LTR؟
- الينقولات العكسية LTR و non-LTR هما النوعان الرئيسيان من الينقولات العكسية.
- كلا النوعين يحتويان على جينات للإنزيمات مثل نطاقات النسخ العكسي وبروتين ربط الحمض النووي الريبي والنوكلياز والريبونوكلياز H.
- يمكن العثور عليها في الجينوم البشري.
- كلا النوعين مهمان من الناحية التطورية
ما هو الفرق بين الينقولات العكسية LTR و Non-LTR؟
الينقولات العكسية LTR لها تكرارات طرفية طويلة في بنيتها ، بينما تفتقر الينقولات العكسية غير LTR إلى التكرارات الطرفية الطويلة في بنيتها.وبالتالي ، هذا هو الفرق الرئيسي بين الينقولات العكسية LTR و non-LTR. علاوة على ذلك ، فإن الينقولات العكسية LTR لها تكرارات مباشرة طويلة وهي مجرد سلسلة واحدة من القواعد التي تكرر نفسها. من ناحية أخرى ، فإن الينقولات الرجعية ليست لها تكرارات قصيرة يمكن أن يكون لها ترتيب مقلوب من القواعد بجانب بعضها البعض.
يعرض الرسم البياني أدناه الاختلافات بين الينقولات العكسية LTR و non-LTR في شكل جدول للمقارنة جنبًا إلى جنب.
ملخص - ترانسبوزونات LTR مقابل غير LTR
الينقولات العكسية LTR و non-LTR هما النوعان الرئيسيان من الينقولات العكسية. الينقولات العكسية LTR لها تكرارات نهائية طويلة في بنيتها ، في حين أن الينقولات العكسية غير LTR ليس لها تكرارات نهائية طويلة في بنيتها. إذن ، هذا هو الفرق الرئيسي بين الينقولات العكسية LTR وغير المنقولة LTR.
