الاختلاف الرئيسي بين ITS1 و ITS2 هو أن ITS1 عبارة عن دنا فاصل يقع بين جينات الرنا الريباسي 18S و 5.8S في حقيقيات النوى ، بينما ITS2 عبارة عن DNA مباعد يقع بين 5.8S و 28S rRNA في حقيقيات النوى.
فاصل النسخ الداخلي (ITS) هو الحمض النووي الفاصل الذي يقع عادة بين الحمض النووي الريبي الريبوسومي الصغير ووحدات فرعية كبيرة من الجينات الريبوسومية RNA في الكروموسوم أو في المنطقة المنسوخة المقابلة في جزيء نسخ سلائف الرنا الريباسي المتعدد الكريات. في البكتيريا والعتائق ، يوجد فقط ITS واحد بين جينات الرنا الريباسي 16S و 23S. ولكن في حقيقيات النوى ، هناك نوعان من الحمض النووي لفاصل ITS: ITS1 (بين 18S و 5.8S rRNA) و ITS2 (بين 5.8S و 28S rRNA). لذلك ، ITS1 و ITS2 هما دنا فاصل موجودان بين جينات الرنا الريباسي في حقيقيات النوى.
ما هو ITS1؟
ITS1 عبارة عن دنا فاصل يقع بين جينات الرنا الريباسي 18S و 5.8S في حقيقيات النوى. يشير ITS إلى قطعة من DNA الفاصل غير الوظيفي الموجود بين جينات الرنا الريباسي. ITS1 له تباين في الطول أكبر من ITS2. يبلغ تباين طول ITS1 تقريبًا (200-300 نقطة أساس). أثبتت علامات ITS مثل ITS1 كفاءتها في توضيح العلاقات التطورية بين الأصناف المختلفة. علاوة على ذلك ، فإن الحمض النووي لفاصل ITS1 أقل حفظًا من الحمض النووي لفاصل ITS2. يتم حفظ هياكل ITS1 فقط في وحدات تصنيفية أصغر بكثير. تحتوي كل مجموعة ريبوسوم حقيقية النواة أيضًا على مناطق تسمى الفواصل المكتوبة الخارجية (5 'و 3' ETS).
الشكل 01: منطقة ITS1
الحمض النووي لفاصل ITS1 قريب جدًا من فاصل النسخ الخارجي 5’(5’ ETS). علاوة على ذلك ، إذا أراد أي شخص تضخيم منطقة ITS1 لدراسات العلاقات النشوء والتطور ، فعليه استخدام زوج تمهيدي محدد (بادئات عكسية وأمامية) لهذا الغرض. لتضخيم منطقة ITS1 ، يتم استخدام مجموعتين من البادئات بشكل طبيعي في بروتوكولات PCR للمختبرات. هم ITS1 إلى الأمام وعكس ITS2 أو ITS1 للأمام وعكس ITS4.
ما هو ITS2؟
ITS2 عبارة عن دنا فاصل يقع بين جينات الرنا الريباسي 5.8S و 28S في حقيقيات النوى. تتميز منطقة ITS2 باختلاف طول أقصر من منطقة ITS1. يبلغ تباين طول ITS2 تقريبًا (180-240 نقطة أساس). ومع ذلك ، فإن منطقة ITS2 أكثر حفظًا من منطقة ITS1 في العديد من الوحدات التصنيفية. يحدد أن جميع تسلسلات ITS2 تشترك في جوهر مشترك للبنية الثانوية. علاوة على ذلك ، يتم حفظ 40 ٪ من منطقة ITS2 بين جميع كاسيات البذور ، في حين أنه من الممكن محاذاة 50 ٪ من منطقة ITS2 عبر الأسرة والمستوى الأعلى.
الشكل 02: منطقة ITS2
بغض النظر عن نطاق الحفظ ، فإن استخدام منطقة ITS2 أيضًا شائع جدًا مثل منطقة ITS1 في دراسات العلاقات التطورية ، خاصة في تشفير DNA الفطري. لتضخيم منطقة ITS2 ، يتم استخدام مجموعة محددة من التمهيدي بشكل عام في بروتوكولات PCR للمختبرات. هذا هو تقدم ITS1 وعكس ITS4. ولكن عندما يستخدم بروتوكول PCR مجموعة التمهيدي هذه ، فإنه يعمل أيضًا على تضخيم منطقة ITS1 مع منطقة ITS2. علاوة على ذلك ، فإن الحمض النووي لفاصل ITS2 قريب جدًا من فاصل النسخ الخارجي 3 (3 'ETS).
أوجه التشابه بين ITS1 و ITS2
- ITS1 و ITS2 هما دنا فاصل يقعان بين جينات الرنا الريباسي.
- هم موجودون فقط في حقيقيات النوى.
- كلاهما يمكن تضخيمهما باستخدام أزواج محددة من البرايمر.
- كلاهما مستأصل في نضوج الرنا الريباسي كمنتجات ثانوية غير وظيفية.
- كلاهما مهم جدًا لدراسات علاقة النشوء والتطور ، خاصةً في تشفير الحمض النووي للفطريات.
الفرق بين ITS1 و ITS2
ITS1 عبارة عن دنا فاصل موجود بين جينات الرنا الريباسي 18S و 5.8S في حقيقيات النوى بينما ITS2 عبارة عن دنا فاصل يقع بين جينات الرنا الريباسي 5.8S و 28S في حقيقيات النوى. إذن ، هذا هو الفرق الرئيسي بين ITS1 و ITS2. علاوة على ذلك ، يتميز ITS1 بتباين أكبر في الطول مقارنة بـ ITS2. من ناحية أخرى ، يتميز ITS2 باختلاف طول أقصر مقارنة بـ ITS1. هذا فرق آخر بين ITS1 و ITS2.
يسرد الرسم البياني أدناه الاختلافات بين ITS1 و ITS2 في شكل جدول للمقارنة جنبًا إلى جنب.
ملخص - ITS1 مقابل ITS2
المنطقة الداخلية المنسوخة (ITS) هي قطعة غير وظيفية من الحمض النووي الفاصل تقع بين جينات الرنا الريباسي. في البكتيريا والعتائق ، لا يوجد سوى منطقة واحدة لأنظمة النقل الذكية.ولكن في حقيقيات النوى ، هناك منطقتان لأنظمة النقل الذكية: ITS1 و ITS2. ITS1 عبارة عن DNA فاصل يقع بين 18S و 5.8S rRNA في حقيقيات النوى ، بينما ITS2 عبارة عن DNA مباعد يقع بين 5.8S و 28S rRNA في حقيقيات النوى. وبالتالي ، هذا هو ملخص الفرق بين ITS1 و ITS2.
