الفرق الرئيسي بين CGH والمصفوفة CGH هو أن CGH هي طريقة وراثية خلوية جزيئية تقليدية لتحليل تباين رقم النسخ في الحمض النووي لعينة اختبار ذات دقة أقل ، في حين أن المصفوفة CGH هي طريقة خلوية جزيئية مؤتمتة بالكامل تحليل تباين رقم النسخ في الحمض النووي لعينة اختبار ذات دقة أعلى.
CGH والمصفوفة CGH هما طريقتان لاكتشاف اختلافات رقم النسخ في الأفراد. يشير تباين رقم النسخ إلى أقسام الجينوم التي يتم تكرارها. يختلف عدد النسخ بين الأفراد. يتم تصنيف تباين رقم النسخ بشكل عام إلى مجموعتين: التكرارات القصيرة والتكرار الطويل.أحد الأمثلة الأكثر شهرة لتغير عدد النسخ القصيرة هو تكرار ثلاثي النوكليوتيد CAG في جين هنتنغتين. هذا يسبب اضطرابًا عصبيًا يسمى هنتنغتين. أفضل مثال على اختلاف عدد النسخ المتكررة الطويلة هو جين ألفا أميليز ، الذي يسبب مقاومة الأنسولين. يمكن اكتشاف اختلاف رقم النسخ عن طريق تقنيات مثل FISH و CGH و CGH المصفوفة.
ما هو CGH؟
CGH هي طريقة وراثية خلوية جزيئية تقليدية لتحليل اختلاف رقم النسخ في الحمض النووي لعينة اختبار مقارنة بعينة مرجعية. تتميز بدقة أقل مقارنة بالتقنيات الآلية. الهدف من هذه التقنية هو إجراء مقارنة سريعة وفعالة بين عينتين من الحمض النووي الجينومي التي تنشأ من مصادر مختلفة.
الشكل 01: CGH
يتضمن الإجراء عزل الحمض النووي من مصدرين: الاختبار والمرجع. ثم الخطوة التالية هي وضع العلامات المستقلة على عينات الحمض النووي المرجعية والاختبار باستخدام فلوروفورز بألوان مختلفة. في وقت لاحق ، تم تغيير طبيعة عينات الحمض النووي اثنين من أجل الحصول على عينات الحمض النووي المفرد تقطعت بهم السبل. أخيرًا ، تم إجراء تهجين لعينتي DNA الناتجتين بنسبة 1: 1 لانتشار الطور الطبيعي للكروموسومات. يمكن التعرف على الفروق الكروموسومية بين المصدرين باستخدام مجهر مضان وبرنامج كمبيوتر. علاوة على ذلك ، فإن تقنية CGH قادرة فقط على اكتشاف تشوهات الكروموسومات غير المتوازنة.
ما هو Array CGH؟
Array CGH هي طريقة خلوية جزيئية مؤتمتة بالكامل لتحليل اختلاف رقم النسخ في الحمض النووي لعينة اختبار مقارنة بعينة مرجعية. تتميز بدقة أعلى ، وقد تم تطويرها لتقليل قيود CGH التقليدية. يجمع Array CGH بين مبادئ CGH واستخدام المصفوفات الدقيقة.بدلاً من استخدام انتشار الكروموسومات الطورية ، تستخدم هذه الطريقة شرائح مصفوفة بأجزاء صغيرة من الحمض النووي كأهداف. تم عمل هذه المصفوفات الدقيقة عن طريق ترسيب وتثبيت كمية صغيرة من الحمض النووي (المجسات) على دعامة زجاجية صلبة. يمكن أن يختلف حجم المجسات من قليل النوكليوتيد إلى الكروموسوم الاصطناعي البكتيري.
الشكل 02: صفيف CGH
بغض النظر عن المجسات ، فإن الطريقة الأساسية للصفيف CGH تشبه CGH. بمجرد تحضير المجسات التي تحتوي على ميكروأري ، يتم خلط عيّنتي الحمض النووي (الاختبار والمرجع) الموصوفين بفلوروفور من ألوان مختلفة معًا وإضافتها إلى المصفوفة الدقيقة. نظرًا لأن الحمض النووي في العينات أحادي الجديلة بسبب التمسخ ، فإن هذا الحمض النووي يتهجين مع تحقيقات مصفوفة وحيدة الجديلة. باستخدام نظام التصوير الرقمي ، من الممكن تحديد الاختلافات الكروموسومية بين المصدرين.
ما هي أوجه التشابه بين CGH و Array CGH؟
- CGH والمصفوفة CGH هما طريقتان لاكتشاف تباينات رقم النسخ.
- هي طرق خلوية جزيئية.
- كلا الطريقتين لتشخيص تشوهات الكروموسومات غير المتوازنة.
- تشارك الفلوروفورات في كلتا الطريقتين.
- يمكن استخدام كلتا الطريقتين للكشف عن الاضطرابات الوراثية بسبب اختلاف عدد النسخ.
- تستخدم على نطاق واسع في التحليل الجينومي المقارن.
ما هو الفرق بين CGH و Array CGH؟
CGH هي طريقة وراثية خلوية جزيئية تقليدية لتحليل تباين رقم النسخ في الحمض النووي لعينة اختبار ذات دقة أقل ، في حين أن المصفوفة CGH هي طريقة خلوية جزيئية مؤتمتة بالكامل لتحليل تباين رقم النسخ في الحمض النووي لعينة الاختبار ذات دقة أعلى. لذلك ، هذا هو الفرق الرئيسي بين CGH و CGH المصفوفة.علاوة على ذلك ، في CGH ، يتم تهجين عينات الحمض النووي المرجعية والاختبار مع انتشار الطور الطبيعي للكروموسومات ، ولكن في مجموعة CGH ، يتم تهجين عينات الحمض النووي المرجعية واختبارها مع تحقيقات الحمض النووي المعطلة التي تحتوي على ميكروأري.
يسرد الرسم البياني أدناه الاختلافات بين CGH و CGH في شكل جدول للمقارنة جنبًا إلى جنب.
ملخص - CGH مقابل Array CGH
CGH والمصفوفة CGH هما طريقتان للوراثة الخلوية الجزيئية للكشف عن تشوهات الكروموسومات غير المتوازنة. تستخدم على نطاق واسع في التحليل الجيني المقارن. CGH هي طريقة وراثية خلوية جزيئية تقليدية لتحليل تباين رقم النسخ في الحمض النووي لعينة اختبار ذات دقة أقل. في المقابل ، فإن المصفوفة CGH هي طريقة خلوية جزيئية مؤتمتة بالكامل لتحليل تباين رقم النسخ في الحمض النووي لعينة اختبار ذات دقة أعلى. وبالتالي ، هذا يلخص الفرق بين CGH و CGH المصفوفة.
